Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G024000.1
Synonym Sb05g001980
Functional annotation rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PPS7
Pfam PF14686 PF14683 PF06045
Panther DB PTHR32018 PTHR32018:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K18195; RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09880 : Rhamnogalacturonate lyase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g03790.1 : rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019504 , Zm00025a019503 , Zm00025a033385
Brachypodium KQK01669 , KQK01670 , KQK01668
Barley HORVU6Hr1G019340.1 , HORVU6Hr1G010870.10 , HORVU4Hr1G026250.6 , HORVU4Hr1G026250.3 , HORVU4Hr1G026250.2 , HORVU4Hr1G026250.1 , HORVU4Hr1G026250.5 , HORVU6Hr1G010870.8 , HORVU6Hr1G010870.9 , HORVU6Hr1G019370.1 , HORVU6Hr1G010870.1 , HORVU6Hr1G010870.2 , HORVU6Hr1G010870.3 , HORVU6Hr1G010870.4 , HORVU6Hr1G010870.5 , HORVU6Hr1G010870.6 , HORVU6Hr1G010870.7 , HORVU4Hr1G026250.4
Wheat TraesCS4A02G187200 , TraesCSU02G121100 , TraesCS6B02G078500 , TraesCS6D02G096400 , TraesCS6A02G055300 , TraesCS6A02G055300 , TraesCS6D02G096200 , TraesCS6A02G108200 , TraesCS6B02G136900 , TraesCS6B02G136800 , TraesCS4B02G130900 , TraesCS6A02G108400 , TraesCS4D02G126300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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