Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G035200.1,Sobic.005G035200.3,Sobic.005G035200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPZ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
2 Sobic.002G145400 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
3 Sobic.004G336401 - -
4 Sobic.007G221932 - -
5 Sobic.001G539880 - -
6 Sobic.008G097800 CAMK_CAMK_like.47 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
7 Sobic.003G195400 - -
8 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G148233 - -
10 Sobic.005G035250 - -
11 Sobic.010G254100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
12 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
13 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
14 Sobic.009G091000 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.11 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
15 Sobic.009G252000 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
16 Sobic.010G034300 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
17 Sobic.007G222700 - -
18 Sobic.001G351600 hydrolase protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G118800 - -
20 Sobic.005G023400 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G035200--Sobic004G024800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic005G035200--Sobic002G145400 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic005G035200--Sobic004G336401 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic005G035200--Sobic007G221932 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic005G035200--Sobic001G539880 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic005G035200--Sobic008G097800 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic005G035200--Sobic003G195400 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic005G035200--Sobic007G080100 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic005G035200--Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic001G539880 Sobic004G024800--Sobic005G035200 Sobic004G024800--Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic003G195400 Sobic004G024800--Sobic007G148233 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic004G024800--Sobic008G011901 Sobic004G024800--Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic007G221932 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G024800--Sobic005G035250 Sobic002G145400--Sobic005G035200 Sobic002G145400--Sobic008G097800 Sobic002G145400--Sobic004G336401 Sobic002G145400--Sobic007G221932 Sobic002G145400--Sobic004G024800 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic002G145400--Sobic010G254100 Sobic002G145400--Sobic007G080100 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic003G195400 Sobic004G336401--Sobic010G254100 Sobic004G336401--Sobic008G097800 Sobic004G336401--Sobic005G035200 Sobic004G336401--Sobic002G145400 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic004G336401--Sobic010G034300 Sobic004G336401--Sobic007G221932 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic004G336401--Sobic009G252000 Sobic004G336401--Sobic009G091000 Sobic004G336401--Sobic004G024800 Sobic007G221932--Sobic009G091000 Sobic007G221932--Sobic008G097800 Sobic007G221932--Sobic009G252000 Sobic007G221932--Sobic005G035200 Sobic007G221932--Sobic002G145400 Sobic007G221932--Sobic004G336401 Sobic007G221932--Sobic010G254100 Sobic007G221932--Sobic010G034300 Sobic007G221932--Sobic007G080100 Sobic001G539880--Sobic007G148233 Sobic001G539880--Sobic003G195400 Sobic001G539880--Sobic004G024800 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic005G035200 Sobic001G539880--Sobic007G080100 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic007G221932 Sobic008G097800--Sobic004G336401 Sobic008G097800--Sobic009G091000 Sobic008G097800--Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic010G254100 Sobic008G097800--Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic005G035200 Sobic008G097800--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic002G225800 Sobic003G195400--Sobic001G539880 Sobic003G195400--Sobic005G035250 Sobic003G195400--Sobic005G035200 Sobic003G195400--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G080100 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic004G158100 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic003G195400--Sobic005G009700 Sobic007G080100--Sobic008G011901 Sobic007G080100--Sobic004G024800 Sobic007G080100--Sobic005G035200 Sobic007G080100--Sobic007G221932 Sobic007G080100--Sobic001G539880 Sobic007G080100--Sobic002G145400 Sobic007G080100--Sobic003G195400 Sobic007G080100--Sobic005G035250 Sobic007G080100--Sobic008G097800 Sobic007G148233--Sobic002G225800 Sobic007G148233--Sobic003G195400 Sobic007G148233--Sobic001G539880 Sobic007G148233--Sobic005G035250 Sobic007G148233--Sobic004G024800 Sobic007G148233--Sobic005G035200 Sobic007G148233--Sobic002G128700 Sobic007G148233--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic007G148233--Sobic001G539820
Octagon: transcription factors


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