Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G080050.1,Sobic.005G080050.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI71
Pfam -
Panther DB PTHR33157 PTHR33157:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G123600 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
2 Sobic.001G357200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11294: NCL, nucleolin
3 Sobic.009G161100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G068300 transferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G033000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.005G165400 OsSub17 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
7 Sobic.001G472000 Polyamine oxidase 1("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K13366: MPAO, polyamine oxidase
8 Sobic.001G323801 - -
9 Sobic.002G415400 - -
10 Sobic.002G415300 - -
11 Sobic.004G076000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Protein peroxiredoxin-5 (Os)(PubMedID : 27208977)@peroxiredoxin, putative, expressed -
12 Sobic.002G141100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.002G329500 Beta amylase BAM (Zm)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
14 Sobic.002G351000 fasciclin domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G261200 formyl transferase, putative, expressed K00604: MTFMT, methionyl-tRNA formyltransferase
16 Sobic.008G163200 OsSCP9 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
17 Sobic.004G019300 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
18 Sobic.007G034500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
19 Sobic.005G110436 - -
20 Sobic.009G115050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G080050 Sobic005G080050 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic005G080050--Sobic008G123600 Sobic001G357200 Sobic001G357200 Sobic005G080050--Sobic001G357200 Sobic009G161100 Sobic009G161100 Sobic005G080050--Sobic009G161100 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic005G080050--Sobic003G068300 Sobic002G033000 Sobic002G033000 Sobic005G080050--Sobic002G033000 Sobic005G165400 Sobic005G165400 Sobic005G080050--Sobic005G165400 Sobic001G472000 Sobic001G472000 Sobic005G080050--Sobic001G472000 Sobic001G323801 Sobic001G323801 Sobic005G080050--Sobic001G323801 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic005G080050--Sobic002G415400 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic008G123600--Sobic004G076000 Sobic003G383600 Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic003G383600 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic008G123600--Sobic001G003600 Sobic008G123600--Sobic001G323801 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G069500 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic008G123600--Sobic001G435600 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic008G123600--Sobic009G115050 Sobic003G295800 Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic003G295800 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic008G123600--Sobic006G172700 Sobic001G188600 Sobic001G188600 Sobic001G357200--Sobic001G188600 Sobic006G114300 Sobic006G114300 Sobic001G357200--Sobic006G114300 Sobic010G012900 Sobic010G012900 Sobic001G357200--Sobic010G012900 Sobic009G001500 Sobic009G001500 Sobic001G357200--Sobic009G001500 Sobic008G030000 Sobic008G030000 Sobic001G357200--Sobic008G030000 Sobic007G034500 Sobic007G034500 Sobic001G357200--Sobic007G034500 Sobic001G357200--Sobic008G123600 Sobic001G357200--Sobic001G069500 Sobic003G383500 Sobic003G383500 Sobic001G357200--Sobic003G383500 Sobic009G161100--Sobic001G472000 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic009G161100--Sobic005G200600 Sobic002G141100 Sobic002G141100 Sobic009G161100--Sobic002G141100 Sobic005G218600 Sobic005G218600 Sobic009G161100--Sobic005G218600 Sobic004G249400 Sobic004G249400 Sobic009G161100--Sobic004G249400 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic009G161100--Sobic001G541300 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic009G161100--Sobic006G238100 Sobic002G209800 Sobic002G209800 Sobic009G161100--Sobic002G209800 Sobic001G315200 Sobic001G315200 Sobic009G161100--Sobic001G315200 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic003G068300--Sobic002G415300 Sobic003G068300--Sobic002G415400 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic003G068300--Sobic008G163200 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic003G068300--Sobic001G255300 Sobic009G206000 Sobic009G206000 Sobic003G068300--Sobic009G206000 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic003G068300--Sobic004G060700 Sobic003G068300--Sobic006G238100 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic003G068300--Sobic002G416950 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic003G068300--Sobic004G328900 Sobic002G033000--Sobic008G123600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic002G033000--Sobic002G329500 Sobic002G033000--Sobic001G435600 Sobic007G185100 Sobic007G185100 Sobic002G033000--Sobic007G185100 Sobic002G033000--Sobic003G383600 Sobic009G215600 Sobic009G215600 Sobic002G033000--Sobic009G215600 Sobic002G033000--Sobic002G415300 Sobic002G033000--Sobic002G415400 Sobic002G033000--Sobic004G076000 Sobic005G165400--Sobic002G415400 Sobic005G165400--Sobic002G415300 Sobic005G165400--Sobic003G068300 Sobic005G165400--Sobic009G115050 Sobic005G165400--Sobic002G329500 Sobic005G165400--Sobic008G163200 Sobic005G165400--Sobic001G435600 Sobic005G165400--Sobic004G060700 Sobic005G165400--Sobic008G123600 Sobic008G189500 Sobic008G189500 Sobic001G472000--Sobic008G189500 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic001G472000--Sobic003G007800 Sobic005G029400 Sobic005G029400 Sobic001G472000--Sobic005G029400 Sobic001G472000--Sobic009G161100 Sobic009G070600 Sobic009G070600 Sobic001G472000--Sobic009G070600 Sobic001G472000--Sobic001G255300 Sobic001G472000--Sobic001G315200 Sobic001G472000--Sobic001G541300 Sobic001G472000--Sobic004G249400 Sobic001G323801--Sobic004G076000 Sobic001G017000 Sobic001G017000 Sobic001G323801--Sobic001G017000 Sobic001G323801--Sobic008G123600 Sobic001G323801--Sobic009G115050 Sobic004G317900 Sobic004G317900 Sobic001G323801--Sobic004G317900 Sobic003G074600 Sobic003G074600 Sobic001G323801--Sobic003G074600 Sobic001G323801--Sobic003G295800 Sobic001G323801--Sobic001G003600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G323801--Sobic005G110436 Sobic002G415400--Sobic002G415300 Sobic002G415400--Sobic001G435600 Sobic002G415400--Sobic004G060700 Sobic002G415400--Sobic003G068300 Sobic002G415400--Sobic008G163200 Sobic002G415400--Sobic009G115050 Sobic002G415400--Sobic002G416950 Sobic002G415400--Sobic002G329500 Sobic002G415400--Sobic006G238100
Octagon: transcription factors


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