Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G088100.1
Synonym Sb05g007170
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y848
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02816 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029535
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G007600 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
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3 Sobic.009G180400 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
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7 Sobic.002G080700 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
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16 Sobic.004G090600 - -
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19 Sobic.001G341200 mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed K06685: MOB1, MOB kinase activator 1
20 Sobic.008G119900 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G088100 Sobic005G088100 Sobic010G007600 Sobic010G007600 Sobic005G088100--Sobic010G007600 Sobic002G277500 Sobic002G277500 Sobic005G088100--Sobic002G277500 Sobic009G180400 Sobic009G180400 Sobic005G088100--Sobic009G180400 Sobic007G024150 Sobic007G024150 Sobic005G088100--Sobic007G024150 Sobic007G138900 Sobic007G138900 Sobic005G088100--Sobic007G138900 Sobic001G396600 Sobic001G396600 Sobic005G088100--Sobic001G396600 Sobic002G080700 Sobic002G080700 Sobic005G088100--Sobic002G080700 Sobic005G077700 Sobic005G077700 Sobic005G088100--Sobic005G077700 Sobic003G216901 Sobic003G216901 Sobic005G088100--Sobic003G216901 Sobic010G007600--Sobic007G138900 Sobic010G007600--Sobic009G180400 Sobic010G007600--Sobic002G277500 Sobic010G007600--Sobic002G080700 Sobic010G007600--Sobic005G077700 Sobic006G021400 Sobic006G021400 Sobic010G007600--Sobic006G021400 Sobic004G090600 Sobic004G090600 Sobic010G007600--Sobic004G090600 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic010G007600--Sobic001G209701 Sobic002G277500--Sobic010G007600 Sobic002G277500--Sobic005G077700 Sobic002G277500--Sobic009G180400 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic002G277500--Sobic004G048500 Sobic002G277500--Sobic001G209701 Sobic009G180400--Sobic005G077700 Sobic009G180400--Sobic006G021400 Sobic009G180400--Sobic004G090600 Sobic001G341200 Sobic001G341200 Sobic009G180400--Sobic001G341200 Sobic009G180400--Sobic004G048500 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic009G180400--Sobic005G080700 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic009G180400--Sobic005G131100 Sobic009G180400--Sobic001G209701 Sobic007G024150--Sobic005G088100 Sobic004G238700 Sobic004G238700 Sobic007G024150--Sobic004G238700 Sobic002G385400 Sobic002G385400 Sobic007G024150--Sobic002G385400 Sobic006G070298 Sobic006G070298 Sobic007G024150--Sobic006G070298 Sobic009G003500 Sobic009G003500 Sobic007G024150--Sobic009G003500 Sobic006G251200 Sobic006G251200 Sobic007G024150--Sobic006G251200 Sobic006G274400 Sobic006G274400 Sobic007G024150--Sobic006G274400 Sobic002G331500 Sobic002G331500 Sobic007G024150--Sobic002G331500 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic007G024150--Sobic002G089600 Sobic007G138900--Sobic010G007600 Sobic007G138900--Sobic002G080700 Sobic007G138900--Sobic009G180400 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic007G138900--Sobic005G027200 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic007G138900--Sobic005G080800 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic007G138900--Sobic005G130900 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic007G138900--Sobic001G349600 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic007G138900--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic007G138900--Sobic010G191400 Sobic010G029450 Sobic010G029450 Sobic001G396600--Sobic010G029450 Sobic001G396600--Sobic005G131100 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic001G396600--Sobic008G122300 Sobic001G396600--Sobic001G341200 Sobic001G396600--Sobic005G077700 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic001G396600--Sobic001G312200 Sobic001G396600--Sobic005G080700 Sobic001G396600--Sobic004G090600 Sobic001G396600--Sobic004G048500 Sobic002G080700--Sobic007G138900 Sobic002G080700--Sobic002G058100 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic002G080700--Sobic004G029500 Sobic002G080700--Sobic010G191400 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic002G080700--Sobic002G095000 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G080700--Sobic010G129300 Sobic002G080700--Sobic001G349600 Sobic002G080700--Sobic010G007600 Sobic002G080700--Sobic005G027200 Sobic005G077700--Sobic001G341200 Sobic005G077700--Sobic001G209701 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic003G216901--Sobic006G007001 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic003G216901--Sobic005G064400 Sobic003G216901--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic003G216901--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic003G216901--Sobic006G006100 Sobic003G216901--Sobic004G029500 Sobic003G216901--Sobic002G095000 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic003G216901--Sobic002G352401 Sobic003G216901--Sobic002G058100
Octagon: transcription factors


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