Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G216901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYF1
Pfam PF00319
Panther DB PTHR11945 PTHR11945:SF207
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01530 : AGAMOUS-like 28
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g11510.1 : OsMADS91 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G007001 - -
2 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G129300 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G081800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.006G006100 expressed protein -
6 Sobic.004G029500 - -
7 Sobic.002G095000 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
8 Sobic.002G352401 - -
9 Sobic.002G058100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
10 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
11 Sobic.004G316400 - -
12 Sobic.010G191400 - -
13 Sobic.006G006000 expressed protein -
14 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.001G349600 cyclin, putative, expressed K18810: cyclin D1/2/4, plant
16 Sobic.002G352501 - -
17 Sobic.005G130900 expressed protein -
18 Sobic.006G194900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G080800 - -
20 Sobic.005G151400 dnaJ domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G216901 Sobic003G216901 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic003G216901--Sobic006G007001 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic003G216901--Sobic005G064400 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic003G216901--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic003G216901--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic003G216901--Sobic006G006100 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic003G216901--Sobic004G029500 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic003G216901--Sobic002G095000 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic003G216901--Sobic002G352401 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic003G216901--Sobic002G058100 Sobic006G007001--Sobic010G129300 Sobic006G007001--Sobic005G064400 Sobic006G007001--Sobic005G081800 Sobic006G007001--Sobic004G029500 Sobic006G007001--Sobic002G095000 Sobic006G007001--Sobic006G006100 Sobic006G007001--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic006G007001--Sobic010G191400 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic006G007001--Sobic006G006000 Sobic005G064400--Sobic006G007001 Sobic005G064400--Sobic010G129300 Sobic005G064400--Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic005G081800 Sobic005G064400--Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic004G029500 Sobic005G064400--Sobic002G095000 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic002G058100 Sobic010G129300--Sobic005G081800 Sobic010G129300--Sobic006G007001 Sobic010G129300--Sobic004G029500 Sobic010G129300--Sobic002G095000 Sobic010G129300--Sobic002G058100 Sobic010G129300--Sobic010G191400 Sobic010G129300--Sobic006G006100 Sobic010G129300--Sobic005G064400 Sobic010G129300--Sobic006G006000 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006000 Sobic006G006100--Sobic006G006000 Sobic006G006100--Sobic005G081800 Sobic006G006100--Sobic010G129300 Sobic006G006100--Sobic006G007001 Sobic006G006100--Sobic002G095000 Sobic006G006100--Sobic004G029500 Sobic006G006100--Sobic005G064400 Sobic006G006100--Sobic002G058100 Sobic006G006100--Sobic010G191400 Sobic004G029500--Sobic002G095000 Sobic004G029500--Sobic002G058100 Sobic004G029500--Sobic010G191400 Sobic004G029500--Sobic010G129300 Sobic004G029500--Sobic005G081800 Sobic004G029500--Sobic005G027200 Sobic004G029500--Sobic006G006000 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic006G007001 Sobic002G095000--Sobic004G029500 Sobic002G095000--Sobic002G058100 Sobic002G095000--Sobic005G081800 Sobic002G095000--Sobic010G191400 Sobic002G095000--Sobic005G027200 Sobic002G095000--Sobic010G129300 Sobic002G095000--Sobic006G006000 Sobic002G095000--Sobic001G349600 Sobic002G095000--Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic002G058100--Sobic005G130900
Octagon: transcription factors


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