Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G135500.1
Synonym CHS, ATCHS, Sb05g019910, TT4
Functional annotation chalcone and stilbene synthases, putative, expressed
UniProt C5Y3E6
Pfam PF08541 PF00195
Panther DB PTHR11877 PTHR11877:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups GO:0008610lipid biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13930 : Chalcone and stilbene synthase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g32610.1 : chalcone and stilbene synthases, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048134
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G135500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.008G069901 - -
20 Sobic.004G162800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic002G267050 Sobic002G267050 Sobic005G135500--Sobic002G267050 Sobic010G212600 Sobic010G212600 Sobic005G135500--Sobic010G212600 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic005G135500--Sobic002G044900 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G135500--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G135500--Sobic002G067050 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic005G135500--Sobic005G201800 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic005G135500--Sobic001G152500 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G135500--Sobic003G002800 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G135500--Sobic001G033701 Sobic002G267050--Sobic005G201800 Sobic005G029866 Sobic005G029866 Sobic002G267050--Sobic005G029866 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G267050--Sobic008G069901 Sobic002G267050--Sobic001G152500 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G267050--Sobic003G046000 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic002G267050--Sobic002G260500 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G267050--Sobic006G076700 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G267050--Sobic006G258200 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G267050--Sobic004G184900 Sobic003G243400 Sobic003G243400 Sobic010G212600--Sobic003G243400 Sobic010G212600--Sobic002G267050 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic010G212600--Sobic009G067200 Sobic010G212600--Sobic001G152500 Sobic010G212600--Sobic002G044900 Sobic010G212600--Sobic005G135500 Sobic010G272400 Sobic010G272400 Sobic010G212600--Sobic010G272400 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic010G212600--Sobic008G053000 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic010G212600--Sobic002G401301 Sobic002G044900--Sobic002G401301 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G044900--Sobic001G060001 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic002G044900--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic002G044900--Sobic008G096401 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic002G044900--Sobic007G120600 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic002G044900--Sobic004G181100 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic002G044900--Sobic003G326100 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic002G044900--Sobic005G207600 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic002G044900--Sobic004G274000 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic003G210701--Sobic001G234700 Sobic002G067050--Sobic001G033701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic002G067050--Sobic001G138500 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic002G067050--Sobic005G207550 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic002G067050--Sobic008G008701 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic002G067050--Sobic004G122700 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic002G067050--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic002G067050--Sobic007G027400 Sobic002G067050--Sobic003G210701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic002G067050--Sobic004G090900 Sobic001G200400 Sobic001G200400 Sobic005G201800--Sobic001G200400 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic005G201800--Sobic003G190701 Sobic005G201800--Sobic001G234700 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic001G152500--Sobic008G045232 Sobic001G152500--Sobic002G267050 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic001G152500--Sobic002G289701 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic001G152500--Sobic005G030200 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic001G152500--Sobic002G191300 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic001G152500--Sobic001G189800 Sobic001G152500--Sobic008G053000 Sobic001G152500--Sobic005G201800 Sobic001G152500--Sobic010G212600 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic003G002800--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic003G002800--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic003G002800--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic007G087500 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic003G002800--Sobic001G152240 Sobic003G002800--Sobic003G046000 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic002G103400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic001G033701 Sobic001G033701--Sobic004G090900 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic001G045300 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic001G033701--Sobic002G289601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G033701--Sobic005G014600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic007G027400 Sobic001G033701--Sobic008G008701 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic001G033701--Sobic009G113300
Octagon: transcription factors


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