Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G139600.1
Synonym Sb05g020370
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt C5Y3R7
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G61750 : RmlC-like cupins superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g33110.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G230800 SCARECROW, putative, expressed -
2 Sobic.006G115532 - -
3 Sobic.007G088600 expressed protein -
4 Sobic.003G008200 thioesterase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G208201 - -
6 Sobic.002G307700 expressed protein -
7 Sobic.010G004800 expressed protein -
8 Sobic.010G236950 - -
9 Sobic.004G233100 - -
10 Sobic.003G373700 - -
11 Sobic.003G030100 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.001G404950 - -
13 Sobic.002G142550 - -
14 Sobic.010G165925 - -
15 Sobic.008G112700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G263151 - -
17 Sobic.008G157400 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
18 Sobic.007G003250 - -
19 Sobic.003G324900 expressed protein -
20 Sobic.006G196800 OsFBX177 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G139600 Sobic005G139600 Sobic005G230800 Sobic005G230800 Sobic005G139600--Sobic005G230800 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic005G139600--Sobic006G115532 Sobic007G088600 Sobic007G088600 Sobic005G139600--Sobic007G088600 Sobic003G008200 Sobic003G008200 Sobic005G139600--Sobic003G008200 Sobic004G208201 Sobic004G208201 Sobic005G139600--Sobic004G208201 Sobic002G307700 Sobic002G307700 Sobic005G139600--Sobic002G307700 Sobic010G004800 Sobic010G004800 Sobic005G139600--Sobic010G004800 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic005G139600--Sobic010G236950 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic005G139600--Sobic004G233100 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic005G230800--Sobic005G035400 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic005G230800--Sobic010G263151 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic005G230800--Sobic010G165925 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic005G230800--Sobic001G209000 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic005G230800--Sobic003G267400 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic005G230800--Sobic006G196800 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic005G230800--Sobic007G003250 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic005G230800--Sobic003G188700 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic005G230800--Sobic001G369701 Sobic006G115532--Sobic004G233100 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic006G115532--Sobic003G373700 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic006G115532--Sobic008G157400 Sobic006G115532--Sobic002G307700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic006G115532--Sobic004G115950 Sobic006G115532--Sobic010G263151 Sobic006G115532--Sobic010G165925 Sobic006G212300 Sobic006G212300 Sobic006G115532--Sobic006G212300 Sobic006G115532--Sobic006G196800 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic007G088600--Sobic001G115200 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G088600--Sobic002G142550 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G088600--Sobic005G107250 Sobic007G088600--Sobic010G165925 Sobic010G116200 Sobic010G116200 Sobic007G088600--Sobic010G116200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic007G088600--Sobic005G019650 Sobic007G088600--Sobic010G236950 Sobic007G088600--Sobic007G003250 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic007G088600--Sobic010G180300 Sobic006G112000 Sobic006G112000 Sobic003G008200--Sobic006G112000 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic003G008200--Sobic003G059600 Sobic002G215866 Sobic002G215866 Sobic003G008200--Sobic002G215866 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic003G008200--Sobic001G175200 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic003G008200--Sobic005G198150 Sobic003G186066 Sobic003G186066 Sobic003G008200--Sobic003G186066 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic003G008200--Sobic006G224600 SobicK004201 SobicK004201 Sobic003G008200--SobicK004201 Sobic003G348900 Sobic003G348900 Sobic003G008200--Sobic003G348900 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic004G208201--Sobic007G043050 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic004G208201--Sobic001G519500 Sobic004G208201--Sobic004G233100 Sobic004G208201--Sobic001G369701 Sobic004G208201--Sobic001G115200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G208201--Sobic010G227600 Sobic004G208201--Sobic010G165925 Sobic004G208201--Sobic006G115532 Sobic004G208201--Sobic005G107250 Sobic002G307700--Sobic004G233100 Sobic002G307700--Sobic006G115532 Sobic002G307700--Sobic001G115200 Sobic002G307700--Sobic010G227600 Sobic002G307700--Sobic005G107250 Sobic002G307700--Sobic005G019650 Sobic002G307700--Sobic010G180300 Sobic002G307700--Sobic002G142550 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic002G307700--Sobic006G185150 Sobic001G531800 Sobic001G531800 Sobic010G004800--Sobic001G531800 Sobic010G004800--Sobic005G139600 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic010G004800--Sobic010G023132 Sobic005G019000 Sobic005G019000 Sobic010G004800--Sobic005G019000 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic010G004800--Sobic009G087360 Sobic010G001400 Sobic010G001400 Sobic010G004800--Sobic010G001400 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic010G004800--Sobic009G073200 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic010G004800--Sobic006G192150 Sobic006G182401 Sobic006G182401 Sobic010G004800--Sobic006G182401 Sobic010G236950--Sobic002G142550 Sobic010G236950--Sobic005G107250 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic010G236950--Sobic010G263051 Sobic010G236950--Sobic010G180300 Sobic010G236950--Sobic005G019650 Sobic010G236950--Sobic010G165925 Sobic010G236950--Sobic001G115200 Sobic010G236950--Sobic006G185150 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic010G236950--Sobic003G025500 Sobic004G233100--Sobic010G227600 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G233100--Sobic001G509901 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic004G233100--Sobic009G248200 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic001G115200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G061100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic006G115532 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic004G233100--Sobic009G206900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.