Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G227500.1,Sobic.005G227500.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A109NDP7 , A0A1B6PU72
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.007G025300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G249233 - -
4 Sobic.005G056100 - -
5 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G174900 - -
7 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G081000 - -
9 Sobic.002G089400 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.008G103066 - -
11 Sobic.007G205100 AP2 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G039700 expressed protein -
13 Sobic.008G088450 - -
14 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
15 Sobic.010G034900 expressed protein -
16 Sobic.009G001600 "kafirin seed storage protein, similar to Beta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@PROLM24 - Prolamin precursor, expressed -
17 Sobic.010G148600 WRKY31, expressed -
18 Sobic.002G367600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@"BG2(Ortholog in rice:Xu et al., 2015)"(PubMedID : 31659863)@cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.001G535900 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
20 Sobic.003G247700 cold acclimation protein WCOR413, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G227500 Sobic005G227500 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic005G227500--Sobic010G109700 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic005G227500--Sobic007G025300 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G227500--Sobic001G249233 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G227500--Sobic005G056100 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G227500--Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G227500--Sobic005G174900 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic005G227500--Sobic010G200400 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic005G227500--Sobic008G081000 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic005G227500--Sobic002G089400 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic010G109700--Sobic008G088450 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic007G025300--Sobic008G103066 Sobic007G025300--Sobic002G089400 Sobic007G025300--Sobic010G200400 Sobic007G025300--Sobic006G062700 Sobic007G025300--Sobic005G174900 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic007G025300--Sobic009G001600 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic007G025300--Sobic002G367600 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic007G025300--Sobic001G535900 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic007G025300--Sobic007G205100 Sobic001G249233--Sobic005G174900 Sobic001G249233--Sobic006G062700 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G249233--Sobic010G148600 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic010G109700 Sobic001G249233--Sobic007G025300 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic005G056100 Sobic001G249233--Sobic008G103066 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic006G062700--Sobic005G174900 Sobic006G062700--Sobic001G249233 Sobic006G062700--Sobic008G103066 Sobic006G062700--Sobic007G025300 Sobic006G062700--Sobic005G140400 Sobic006G062700--Sobic010G148600 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic001G112250 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic010G109700 Sobic005G174900--Sobic001G249233 Sobic005G174900--Sobic006G062700 Sobic005G174900--Sobic005G140400 Sobic005G174900--Sobic007G025300 Sobic005G174900--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic010G148600 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G174900--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic007G070700 Sobic010G200400--Sobic007G205100 Sobic010G200400--Sobic002G089400 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic010G200400--Sobic002G338600 Sobic002G028100 Sobic002G028100 Sobic010G200400--Sobic002G028100 Sobic010G200400--Sobic007G025300 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic010G200400--Sobic008G081700 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic010G200400--Sobic010G200200 Sobic010G200400--Sobic002G367600 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic010G200400--Sobic009G116500 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic008G081000--Sobic001G068200 Sobic002G089400--Sobic010G200400 Sobic002G089400--Sobic007G205100 Sobic002G089400--Sobic002G028100 Sobic002G089400--Sobic002G338600 Sobic002G089400--Sobic007G025300 Sobic001G297800 Sobic001G297800 Sobic002G089400--Sobic001G297800 Sobic002G089400--Sobic002G367600 Sobic002G089400--Sobic009G116500 Sobic002G089400--Sobic001G535900
Octagon: transcription factors


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