Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G029200.1
Synonym ALE, ALE1, Sb06g003020
Functional annotation OsSub52 - Putative Subtilisin homologue, expressed
UniProt C5YD59
Pfam PF05922 PF00082
Panther DB PTHR10795 PTHR10795:SF390
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004252serine-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G62340 : PA-domain containing subtilase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g48650.1 : OsSub52 - Putative Subtilisin homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055604 , Zm00025a055603
Brachypodium KQK13050
Barley -
Wheat TraesCS2D02G029200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G268500 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
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20 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G029200 Sobic006G029200 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic006G029200--Sobic010G268500 Sobic003G031001 Sobic003G031001 Sobic006G029200--Sobic003G031001 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic006G029200--Sobic002G220400 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic006G029200--Sobic002G423901 Sobic001G175400 Sobic001G175400 Sobic006G029200--Sobic001G175400 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G029200--Sobic009G218700 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic006G029200--Sobic007G011100 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic006G029200--Sobic010G276850 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic006G029200--Sobic005G093901 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic010G268500--Sobic001G022700 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic010G268500--Sobic002G413100 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic010G268500--Sobic005G104900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic010G268500--Sobic005G139750 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic010G268500--Sobic003G161900 Sobic004G077700 Sobic004G077700 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