Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G175400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QJH8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G175400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G104200 berberine and berberine like domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G028500 expressed protein -
3 Sobic.004G337850 - -
4 Sobic.001G138100 - -
5 Sobic.007G010100 expressed protein -
6 Sobic.009G255000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
8 Sobic.004G019550 - -
9 Sobic.006G057050 - -
10 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
11 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G135701 - -
14 Sobic.006G057100 - -
15 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
16 Sobic.010G035600 - -
17 Sobic.003G119750 - -
18 Sobic.002G220400 - -
19 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G113566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G175400 Sobic001G175400 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic001G175400--Sobic004G104200 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic001G175400--Sobic005G028500 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic001G175400--Sobic004G337850 Sobic001G138100 Sobic001G138100 Sobic001G175400--Sobic001G138100 Sobic007G010100 Sobic007G010100 Sobic001G175400--Sobic007G010100 Sobic009G255000 Sobic009G255000 Sobic001G175400--Sobic009G255000 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G175400--Sobic006G192600 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G175400--Sobic004G019550 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic001G175400--Sobic006G057050 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic004G104200--Sobic004G282933 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic004G104200--Sobic009G192200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic004G104200--Sobic007G085900 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic004G104200--Sobic008G140050 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic004G104200--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 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Octagon: transcription factors


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