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Transcriptome id Sobic.001G138100.1
Synonym
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UniProt A0A1B6QIV1
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G057050 - -
2 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
3 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
4 Sobic.004G251400 - -
5 Sobic.003G172701 - -
6 Sobic.004G337600 - -
7 Sobic.005G093901 - -
8 Sobic.004G337850 - -
9 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
10 Sobic.009G148950 - -
11 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
12 Sobic.002G130200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G110493 - -
14 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
15 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
16 Sobic.003G168500 chloroplast 50S ribosomal protein L20, putative, expressed K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
17 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
18 Sobic.002G148166 - -
19 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
20 Sobic.002G150032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G138100 Sobic001G138100 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic001G138100--Sobic006G057050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic001G138100--Sobic007G109200 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic001G138100--Sobic004G087000 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic001G138100--Sobic004G251400 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic001G138100--Sobic003G172701 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic001G138100--Sobic004G337600 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic001G138100--Sobic005G093901 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic001G138100--Sobic004G337850 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic001G138100--Sobic003G172900 Sobic006G057050--Sobic003G172701 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G057050--Sobic009G123100 Sobic006G057050--Sobic004G337850 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic006G057050--Sobic009G148950 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic006G057050--Sobic003G172500 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic006G057050--Sobic005G110493 Sobic006G057050--Sobic007G109200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic006G057050--Sobic004G087050 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic006G057050--Sobic010G052866 Sobic007G109200--Sobic004G087000 Sobic007G109200--Sobic003G172701 Sobic007G109200--Sobic004G251400 Sobic007G109200--Sobic003G172900 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic007G109200--Sobic002G148166 Sobic007G109200--Sobic006G057050 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic007G109200--Sobic003G169300 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic007G109200 Sobic004G087000--Sobic004G251400 Sobic004G087000--Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172701 Sobic004G087000--Sobic002G148166 Sobic004G087000--Sobic003G173266 Sobic004G087000--Sobic003G169300 Sobic004G087000--Sobic005G110493 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic004G087000--Sobic002G222000 Sobic004G251400--Sobic003G172900 Sobic004G251400--Sobic004G087000 Sobic004G251400--Sobic007G109200 Sobic004G251400--Sobic003G173266 Sobic004G251400--Sobic003G169300 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic004G251400--Sobic003G172850 Sobic004G251400--Sobic004G337600 Sobic004G251400--Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G337600--Sobic003G168500 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic004G337600--Sobic002G044500 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G337600--Sobic008G160300 Sobic004G337600--Sobic004G251400 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G337600--Sobic003G171900 Sobic004G337600--Sobic003G172900 Sobic004G337600--Sobic003G169300 Sobic004G337600--Sobic003G172850 Sobic004G337600--Sobic005G110493 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic009G148950 Sobic005G093901--Sobic003G172701 Sobic005G093901--Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic002G270733 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic005G093901--Sobic003G117850 Sobic005G093901--Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic006G057050 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G093901--Sobic001G022700 Sobic004G337850--Sobic006G057050 Sobic004G337850--Sobic009G123100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic004G337850--Sobic003G352000 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic004G337850--Sobic010G035600 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic004G337850--Sobic007G145801 Sobic004G337850--Sobic003G172500 SobicK029400 SobicK029400 Sobic004G337850--SobicK029400 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G337850--Sobic003G168200 Sobic004G337850--Sobic009G148950 Sobic003G172900--Sobic004G251400 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic003G172900--Sobic002G150032 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G172900--Sobic001G266000 Sobic003G172900--Sobic003G173266 Sobic003G172900--Sobic004G087000 Sobic003G172900--Sobic003G172850 Sobic003G172900--Sobic002G044500 Sobic003G172900--Sobic002G222000 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic003G172900--Sobic002G149966
Octagon: transcription factors


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