Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G039300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJY7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016864 , Zm00025a008037
Brachypodium KQK13343
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G024800 phytase, putative, expressed -
2 Sobic.002G230201 - -
3 Sobic.002G232100 purine permease, putative, expressed -
4 Sobic.003G072566 - -
5 Sobic.002G109900 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
6 Sobic.010G157600 expressed protein -
7 Sobic.004G194950 - -
8 Sobic.003G413550 - -
9 Sobic.007G066908 - -
10 Sobic.007G223801 - -
11 Sobic.002G286500 carrier, putative, expressed -
12 Sobic.006G171801 - -
13 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
14 Sobic.001G060800 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
15 Sobic.003G023901 - -
16 Sobic.009G245650 - -
17 Sobic.009G258000 S-locus lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G359500 - -
19 Sobic.002G061100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
20 Sobic.003G350850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G039300 Sobic006G039300 Sobic002G024800 Sobic002G024800 Sobic006G039300--Sobic002G024800 Sobic002G230201 Sobic002G230201 Sobic006G039300--Sobic002G230201 Sobic002G232100 Sobic002G232100 Sobic006G039300--Sobic002G232100 Sobic003G072566 Sobic003G072566 Sobic006G039300--Sobic003G072566 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic006G039300--Sobic002G109900 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic006G039300--Sobic010G157600 Sobic004G194950 Sobic004G194950 Sobic006G039300--Sobic004G194950 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic006G039300--Sobic003G413550 Sobic007G066908 Sobic007G066908 Sobic006G039300--Sobic007G066908 Sobic002G024800--Sobic007G066908 Sobic002G024650 Sobic002G024650 Sobic002G024800--Sobic002G024650 Sobic001G121850 Sobic001G121850 Sobic002G024800--Sobic001G121850 Sobic001G037600 Sobic001G037600 Sobic002G230201--Sobic001G037600 Sobic001G420600 Sobic001G420600 Sobic002G230201--Sobic001G420600 Sobic008G068166 Sobic008G068166 Sobic002G230201--Sobic008G068166 Sobic007G067300 Sobic007G067300 Sobic002G230201--Sobic007G067300 Sobic001G342700 Sobic001G342700 Sobic002G230201--Sobic001G342700 Sobic005G169100 Sobic005G169100 Sobic002G230201--Sobic005G169100 Sobic010G102100 Sobic010G102100 Sobic002G230201--Sobic010G102100 Sobic006G206900 Sobic006G206900 Sobic002G230201--Sobic006G206900 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic002G230201--Sobic009G009400 Sobic002G232100--Sobic004G194950 Sobic003G350850 Sobic003G350850 Sobic002G232100--Sobic003G350850 Sobic002G232100--Sobic010G157600 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic002G232100--Sobic002G143600 Sobic007G223801 Sobic007G223801 Sobic002G232100--Sobic007G223801 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic002G232100--Sobic006G171801 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic002G232100--Sobic009G184450 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic002G232100--Sobic010G028366 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic002G232100--Sobic001G258700 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic003G072566--Sobic008G166000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G072566--Sobic003G372950 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic003G072566--Sobic005G057600 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic003G072566--Sobic007G059800 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic003G072566--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic003G072566--Sobic003G064000 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic003G072566--Sobic004G201200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic003G072566--Sobic008G154200 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic003G072566--Sobic001G062200 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic002G109900--Sobic001G315300 Sobic003G023901 Sobic003G023901 Sobic002G109900--Sobic003G023901 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic002G109900--Sobic002G286500 Sobic002G109900--Sobic007G223801 Sobic002G109900--Sobic010G157600 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic002G109900--Sobic001G074900 Sobic004G039800 Sobic004G039800 Sobic002G109900--Sobic004G039800 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic002G109900--Sobic001G184950 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic002G109900--Sobic009G258000 Sobic010G157600--Sobic006G171801 Sobic010G157600--Sobic004G194950 Sobic010G157600--Sobic009G184450 Sobic010G157600--Sobic002G232100 Sobic010G157600--Sobic010G028366 Sobic010G157600--Sobic007G223801 Sobic010G157600--Sobic002G109900 Sobic010G157600--Sobic003G350850 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic010G157600--Sobic002G136500 Sobic004G194950--Sobic002G232100 Sobic004G194950--Sobic010G157600 Sobic004G194950--Sobic003G350850 Sobic004G194950--Sobic002G143600 Sobic004G194950--Sobic009G184450 Sobic004G194950--Sobic006G171801 Sobic004G194950--Sobic007G223801 Sobic004G194950--Sobic010G028366 Sobic004G194950--Sobic001G258700 Sobic006G227050 Sobic006G227050 Sobic003G413550--Sobic006G227050 Sobic007G028766 Sobic007G028766 Sobic003G413550--Sobic007G028766 Sobic003G413550--Sobic002G109900 Sobic001G060800 Sobic001G060800 Sobic003G413550--Sobic001G060800 Sobic003G413550--Sobic010G157600 Sobic004G120400 Sobic004G120400 Sobic003G413550--Sobic004G120400 Sobic003G413550--Sobic009G258000 Sobic002G359500 Sobic002G359500 Sobic003G413550--Sobic002G359500 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic003G413550--Sobic010G093200 Sobic007G015800 Sobic007G015800 Sobic007G066908--Sobic007G015800 Sobic007G066908--Sobic002G024800 Sobic007G066908--Sobic002G024650 Sobic007G066908--Sobic001G121850
Octagon: transcription factors


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