Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G084800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RD02
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011325
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G215000 stilbene synthase, putative, expressed -
2 Sobic.008G163100 OsFBX436 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G480200 THO complex subunit 1, putative, expressed -
4 Sobic.006G187300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.007G049200 expressed protein -
6 Sobic.006G165300 OsSub42 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
7 Sobic.002G280800 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G511800 expressed protein -
9 Sobic.007G188400 expressed protein -
10 Sobic.006G137000 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G
11 Sobic.004G041700 expressed protein -
12 Sobic.005G010600 LTPL58 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.005G054800 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
14 Sobic.006G097100 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G062100 A tissue specific expression in primordial inflorescences(PubMedID : 27501690)@OsSPL5 - SBP-box gene family member, expressed -
16 Sobic.003G444400 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G159100 expressed protein -
18 Sobic.001G320300 HOTHEAD precursor, putative, expressed -
19 Sobic.007G001700 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
20 Sobic.006G267400 CRP2 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G084800 Sobic006G084800 Sobic001G215000 Sobic001G215000 Sobic006G084800--Sobic001G215000 Sobic008G163100 Sobic008G163100 Sobic006G084800--Sobic008G163100 Sobic001G480200 Sobic001G480200 Sobic006G084800--Sobic001G480200 Sobic006G187300 Sobic006G187300 Sobic006G084800--Sobic006G187300 Sobic007G049200 Sobic007G049200 Sobic006G084800--Sobic007G049200 Sobic006G165300 Sobic006G165300 Sobic006G084800--Sobic006G165300 Sobic002G280800 Sobic002G280800 Sobic006G084800--Sobic002G280800 Sobic001G511800 Sobic001G511800 Sobic006G084800--Sobic001G511800 Sobic007G188400 Sobic007G188400 Sobic006G084800--Sobic007G188400 Sobic001G215000--Sobic006G187300 Sobic001G320300 Sobic001G320300 Sobic001G215000--Sobic001G320300 Sobic006G097100 Sobic006G097100 Sobic001G215000--Sobic006G097100 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic001G215000--Sobic006G137000 Sobic001G215000--Sobic006G165300 Sobic008G176200 Sobic008G176200 Sobic001G215000--Sobic008G176200 Sobic005G010600 Sobic005G010600 Sobic001G215000--Sobic005G010600 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic001G215000--Sobic003G004900 Sobic004G041700 Sobic004G041700 Sobic001G215000--Sobic004G041700 Sobic008G163100--Sobic007G049200 Sobic008G163100--Sobic006G165300 Sobic001G159100 Sobic001G159100 Sobic008G163100--Sobic001G159100 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic008G163100--Sobic006G267400 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic008G163100--Sobic004G062100 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic008G163100--Sobic007G000600 Sobic008G163100--Sobic006G137000 Sobic010G259400 Sobic010G259400 Sobic008G163100--Sobic010G259400 Sobic003G263800 Sobic003G263800 Sobic008G163100--Sobic003G263800 Sobic001G480200--Sobic001G215000 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic001G480200--Sobic008G013500 Sobic005G149100 Sobic005G149100 Sobic001G480200--Sobic005G149100 Sobic001G480200--Sobic008G176200 Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic001G480200--Sobic008G159601 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic001G480200--Sobic007G049500 Sobic007G024600 Sobic007G024600 Sobic001G480200--Sobic007G024600 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic001G480200--Sobic007G153100 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic001G480200--Sobic004G234400 Sobic006G187300--Sobic001G215000 Sobic006G187300--Sobic006G165300 Sobic006G187300--Sobic003G004900 Sobic006G187300--Sobic001G320300 Sobic006G187300--Sobic006G097100 Sobic006G187300--Sobic006G137000 Sobic001G133100 Sobic001G133100 Sobic006G187300--Sobic001G133100 Sobic007G180700 Sobic007G180700 Sobic006G187300--Sobic007G180700 Sobic006G187300--Sobic005G010600 Sobic007G049200--Sobic008G163100 Sobic007G049200--Sobic006G165300 Sobic007G049200--Sobic006G267400 Sobic007G049200--Sobic001G159100 Sobic004G202800 Sobic004G202800 Sobic007G049200--Sobic004G202800 Sobic010G236000 Sobic010G236000 Sobic007G049200--Sobic010G236000 Sobic007G049200--Sobic006G137000 Sobic006G006800 Sobic006G006800 Sobic007G049200--Sobic006G006800 Sobic007G049200--Sobic007G000600 Sobic006G165300--Sobic006G267400 Sobic006G165300--Sobic003G004900 Sobic006G165300--Sobic007G180700 Sobic004G001700 Sobic004G001700 Sobic006G165300--Sobic004G001700 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic006G165300--Sobic006G098300 Sobic006G165300--Sobic007G000600 Sobic002G270400 Sobic002G270400 Sobic006G165300--Sobic002G270400 Sobic002G173300 Sobic002G173300 Sobic006G165300--Sobic002G173300 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic006G165300--Sobic004G349150 Sobic007G001700 Sobic007G001700 Sobic002G280800--Sobic007G001700 Sobic002G280800--Sobic006G084800 Sobic001G141333 Sobic001G141333 Sobic002G280800--Sobic001G141333 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic002G280800--Sobic004G173300 Sobic009G189600 Sobic009G189600 Sobic002G280800--Sobic009G189600 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic002G280800--Sobic006G089266 Sobic003G440200 Sobic003G440200 Sobic002G280800--Sobic003G440200 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic002G280800--Sobic005G131500 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic002G280800--Sobic009G253900 Sobic001G511800--Sobic007G188400 Sobic001G511800--Sobic008G176200 Sobic001G511800--Sobic006G097100 Sobic001G511800--Sobic004G041700 Sobic001G511800--Sobic001G320300 Sobic001G511800--Sobic001G215000 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic001G511800--Sobic005G054800 Sobic001G511800--Sobic005G010600 Sobic001G511800--Sobic006G137000 Sobic007G188400--Sobic001G511800 Sobic007G188400--Sobic004G041700 Sobic007G188400--Sobic006G097100 Sobic007G188400--Sobic008G176200 Sobic007G188400--Sobic005G054800 Sobic007G188400--Sobic001G320300 Sobic007G188400--Sobic001G215000 Sobic007G188400--Sobic005G010600 Sobic007G188400--Sobic006G137000
Octagon: transcription factors


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