Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G110500.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RDR3
Pfam PF00161
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g35425.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G252301 - -
2 Sobic.001G055300 expressed protein -
3 Sobic.004G061300 expressed protein -
4 Sobic.009G055700 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
5 Sobic.001G325500 expressed protein -
6 Sobic.004G286450 - -
7 Sobic.010G131101 - -
8 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G372950 - -
10 Sobic.003G064000 expressed protein -
11 Sobic.006G107332 - -
12 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G133800 - -
14 Sobic.003G318350 - -
15 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G167850 - -
17 Sobic.002G269800 - -
18 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G057600 expressed protein -
20 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G110500 Sobic006G110500 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic006G110500--Sobic010G252301 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic006G110500--Sobic001G055300 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic006G110500--Sobic004G061300 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic006G110500--Sobic009G055700 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic006G110500--Sobic001G325500 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic006G110500--Sobic004G286450 Sobic010G131101 Sobic010G131101 Sobic006G110500--Sobic010G131101 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G110500--Sobic008G154200 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic006G110500--Sobic003G372950 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic010G252301--Sobic010G045966 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic010G252301--Sobic002G025900 Sobic010G252301--Sobic001G325500 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic010G252301--Sobic005G183900 Sobic005G110350 Sobic005G110350 Sobic010G252301--Sobic005G110350 Sobic010G252301--Sobic009G055700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic010G252301--Sobic003G348300 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic010G252301--Sobic002G325000 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic010G252301--Sobic004G092950 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G055300--Sobic006G107332 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic001G055300--Sobic005G057600 Sobic001G055300--Sobic003G372950 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic001G055300--Sobic007G059800 Sobic001G055300--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic001G055300--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic001G055300--Sobic001G062200 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G055300--Sobic004G201200 Sobic001G055300--Sobic008G154200 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic007G059800 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic005G181700 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic004G061300--Sobic003G286650 Sobic004G061300--Sobic004G201200 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G061300--Sobic001G025201 Sobic004G061300--Sobic005G057600 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G061300--Sobic003G318400 Sobic004G061300--Sobic001G062200 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic009G055700--Sobic009G190100 Sobic009G055700--Sobic003G348300 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic009G055700--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic009G055700--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic009G055700--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic009G055700--Sobic002G269800 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic009G055700--Sobic001G461101 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic009G055700--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic009G055700--Sobic003G126700 Sobic001G325500--Sobic010G252301 Sobic001G325500--Sobic010G045966 Sobic001G325500--Sobic002G025900 Sobic001G325500--Sobic005G183900 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic001G325500--Sobic010G025600 Sobic001G325500--Sobic004G061300 Sobic010G094750 Sobic010G094750 Sobic001G325500--Sobic010G094750 Sobic001G325500--Sobic004G026900 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic001G325500--Sobic008G053500 Sobic004G286450--Sobic003G372950 Sobic004G286450--Sobic003G064000 Sobic004G286450--Sobic008G154200 Sobic004G286450--Sobic005G057600 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic004G286450--Sobic006G167850 Sobic004G286450--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic004G286450--Sobic001G443850 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic004G286450--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic004G286450--Sobic007G154001 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic010G131101--Sobic007G193000 Sobic010G131101--Sobic003G126700 Sobic010G131101--Sobic002G269800 Sobic010G131101--Sobic006G223700 Sobic010G131101--Sobic008G154200 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic010G131101--Sobic003G318350 Sobic010G131101--Sobic003G064000 Sobic010G131101--Sobic009G156700 Sobic010G131101--Sobic009G197350 Sobic008G154200--Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G372950 Sobic008G154200--Sobic004G286450 Sobic008G154200--Sobic006G223700 Sobic008G154200--Sobic006G167850 Sobic008G154200--Sobic003G126700 Sobic008G154200--Sobic005G057600 Sobic008G154200--Sobic001G443850 Sobic008G154200--Sobic002G269800 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic003G372950--Sobic007G154001
Octagon: transcription factors


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