Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G138850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDR9
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33127 PTHR33127:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g66260.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G062950 - -
2 Sobic.007G031500 GEX1, putative, expressed -
3 Sobic.008G079733 - -
4 Sobic.003G268500 - -
5 Sobic.006G075100 UDP-Glycosyltransferase superfamily protein(PubMedID : 26465154)@digalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K09480: digalactosyldiacylglycerol synthase
6 Sobic.002G168100 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G141900 - -
8 Sobic.008G094900 - -
9 Sobic.008G139250 - -
10 Sobic.004G212250 - -
11 Sobic.010G196433 - -
12 Sobic.006G201350 - -
13 Sobic.002G345900 - -
14 Sobic.003G358000 kinase, pfkB family, putative, expressed -
15 Sobic.010G185850 - -
16 Sobic.003G347480 - -
17 Sobic.004G358200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G208275 - -
19 Sobic.008G020600 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
20 Sobic.006G189900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G138850 Sobic006G138850 Sobic010G062950 Sobic010G062950 Sobic006G138850--Sobic010G062950 Sobic007G031500 Sobic007G031500 Sobic006G138850--Sobic007G031500 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic006G138850--Sobic008G079733 Sobic003G268500 Sobic003G268500 Sobic006G138850--Sobic003G268500 Sobic006G075100 Sobic006G075100 Sobic006G138850--Sobic006G075100 Sobic002G168100 Sobic002G168100 Sobic006G138850--Sobic002G168100 Sobic005G141900 Sobic005G141900 Sobic006G138850--Sobic005G141900 Sobic008G094900 Sobic008G094900 Sobic006G138850--Sobic008G094900 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic006G138850--Sobic008G139250 Sobic010G062950--Sobic007G031500 Sobic010G062950--Sobic002G168100 Sobic006G201350 Sobic006G201350 Sobic010G062950--Sobic006G201350 Sobic010G062950--Sobic006G138850 Sobic001G543000 Sobic001G543000 Sobic010G062950--Sobic001G543000 Sobic010G062950--Sobic005G141900 Sobic010G062950--Sobic006G075100 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic010G062950--Sobic004G212250 Sobic002G231700 Sobic002G231700 Sobic010G062950--Sobic002G231700 Sobic007G031500--Sobic010G062950 Sobic007G031500--Sobic002G168100 Sobic007G031500--Sobic006G138850 Sobic007G031500--Sobic006G075100 Sobic007G031500--Sobic006G201350 Sobic007G031500--Sobic005G141900 Sobic007G031500--Sobic001G543000 Sobic007G031500--Sobic008G079733 Sobic003G347480 Sobic003G347480 Sobic007G031500--Sobic003G347480 Sobic008G079733--Sobic008G139250 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic008G079733--Sobic004G358200 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic008G079733--Sobic005G031901 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic008G079733--Sobic003G126750 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic008G079733--Sobic006G109600 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic008G079733--Sobic001G261464 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic008G079733--Sobic010G147300 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic008G079733--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic008G079733--Sobic002G026150 Sobic002G345900 Sobic002G345900 Sobic003G268500--Sobic002G345900 Sobic010G128200 Sobic010G128200 Sobic003G268500--Sobic010G128200 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic003G268500--Sobic001G369550 Sobic004G095400 Sobic004G095400 Sobic003G268500--Sobic004G095400 Sobic003G268500--Sobic008G139250 Sobic003G268500--Sobic008G079733 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic003G268500--Sobic010G196433 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic003G268500--Sobic008G068133 Sobic003G268500--Sobic008G094900 Sobic006G075100--Sobic010G062950 Sobic006G075100--Sobic007G031500 Sobic006G075100--Sobic002G168100 Sobic006G075100--Sobic008G079733 Sobic010G185850 Sobic010G185850 Sobic006G075100--Sobic010G185850 Sobic006G075100--Sobic004G212250 Sobic006G075100--Sobic006G138850 Sobic006G075100--Sobic006G201350 Sobic006G075100--Sobic008G094900 Sobic002G168100--Sobic001G543000 Sobic002G168100--Sobic010G062950 Sobic002G168100--Sobic002G231700 Sobic002G168100--Sobic006G201350 Sobic009G235801 Sobic009G235801 Sobic002G168100--Sobic009G235801 Sobic002G168100--Sobic007G031500 Sobic010G212900 Sobic010G212900 Sobic002G168100--Sobic010G212900 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic002G168100--Sobic001G452400 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic002G168100--Sobic007G100275 Sobic005G141900--Sobic010G062950 Sobic002G248800 Sobic002G248800 Sobic005G141900--Sobic002G248800 Sobic005G141900--Sobic007G031500 Sobic004G101800 Sobic004G101800 Sobic005G141900--Sobic004G101800 Sobic005G141900--Sobic004G212250 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic005G141900--Sobic010G083100 Sobic005G141900--Sobic006G201350 Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic005G141900--Sobic001G144100 Sobic005G141900--Sobic002G168100 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic008G094900--Sobic008G111150 Sobic003G358000 Sobic003G358000 Sobic008G094900--Sobic003G358000 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic008G094900--Sobic001G061300 Sobic008G094900--Sobic004G212250 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic008G094900--Sobic002G228300 Sobic008G094900--Sobic008G079733 Sobic008G094900--Sobic002G345900 Sobic008G094900--Sobic003G268500 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic008G094900--Sobic002G127300 Sobic008G139250--Sobic005G031901 Sobic008G139250--Sobic001G261464 Sobic008G139250--Sobic003G126750 Sobic008G139250--Sobic006G109600 Sobic008G139250--Sobic004G358200 Sobic008G139250--Sobic010G147300 Sobic008G139250--Sobic002G100100 Sobic008G139250--Sobic008G079733 Sobic008G139250--Sobic002G026150
Octagon: transcription factors


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