Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G208275.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJP4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G028650 - -
2 Sobic.006G146150 - -
3 Sobic.001G461101 - -
4 Sobic.001G404950 - -
5 Sobic.003G340500 curculin-like lectin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G074500 - -
7 Sobic.001G061300 - -
8 Sobic.001G221700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G238000 - -
10 Sobic.008G187450 - -
11 Sobic.003G348300 expressed protein -
12 Sobic.003G076300 - -
13 Sobic.009G235801 - -
14 Sobic.003G156600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsMADS93 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed -
15 Sobic.004G212250 - -
16 Sobic.001G299300 - -
17 Sobic.002G162900 - -
18 Sobic.002G262250 - -
19 Sobic.007G193000 expressed protein -
20 Sobic.001G195866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G208275 Sobic005G208275 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic005G208275--Sobic009G028650 Sobic006G146150 Sobic006G146150 Sobic005G208275--Sobic006G146150 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic005G208275--Sobic001G461101 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic005G208275--Sobic001G404950 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic005G208275--Sobic003G340500 Sobic001G074500 Sobic001G074500 Sobic005G208275--Sobic001G074500 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic005G208275--Sobic001G061300 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic005G208275--Sobic001G221700 Sobic004G238000 Sobic004G238000 Sobic005G208275--Sobic004G238000 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic009G028650--Sobic008G187450 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic009G028650--Sobic004G007166 Sobic009G028650--Sobic001G221700 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic009G028650--Sobic004G272000 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic009G028650--Sobic002G070500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic009G028650--Sobic008G176266 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic009G028650--Sobic008G026500 Sobic009G028650--Sobic005G208275 Sobic009G028650--Sobic001G061300 Sobic006G146150--Sobic004G238000 Sobic006G146150--Sobic001G074500 Sobic006G146150--Sobic001G461101 Sobic006G146150--Sobic005G208275 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic006G146150--Sobic009G026900 Sobic006G146150--Sobic001G221700 Sobic009G235801 Sobic009G235801 Sobic006G146150--Sobic009G235801 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic006G146150--Sobic003G361150 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic006G146150--Sobic009G178000 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic001G461101--Sobic009G055700 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic001G461101--Sobic009G190100 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic001G461101--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic001G461101--Sobic007G145300 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic001G461101--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic001G461101--Sobic001G100650 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic001G461101--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic001G461101--Sobic009G156700 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic001G461101--Sobic005G080075 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic001G404950--Sobic003G383000 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic001G404950--Sobic008G157400 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic001G404950--Sobic003G198850 Sobic001G404950--Sobic001G461101 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic001G404950--Sobic001G072100 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic001G404950--Sobic003G288700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic003G340500 Sobic001G404950--Sobic009G190100 Sobic003G340500--Sobic001G461101 Sobic003G340500--Sobic009G190100 Sobic003G340500--Sobic008G157400 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G340500--Sobic008G133750 Sobic003G340500--Sobic009G055700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic003G340500--Sobic003G348300 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G340500--Sobic008G053800 Sobic003G340500--Sobic001G404950 Sobic003G340500--Sobic002G082350 Sobic001G074500--Sobic001G461101 Sobic001G074500--Sobic009G055700 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic001G074500--Sobic007G193000 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic001G074500--Sobic010G133800 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic001G074500--Sobic007G003300 Sobic001G074500--Sobic009G190100 Sobic001G074500--Sobic003G348300 Sobic001G074500--Sobic003G361150 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic001G074500--Sobic002G269800 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic001G061300--Sobic003G067600 Sobic003G304000 Sobic003G304000 Sobic001G061300--Sobic003G304000 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic001G061300--Sobic002G274000 Sobic001G061300--Sobic009G028650 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic001G061300--Sobic002G228300 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic001G061300--Sobic005G182100 Sobic003G358000 Sobic003G358000 Sobic001G061300--Sobic003G358000 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic001G061300--Sobic002G127300 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic001G061300--Sobic004G212250 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic001G221700--Sobic008G060800 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic001G221700--Sobic001G195866 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G221700--Sobic002G262250 Sobic001G221700--Sobic003G348300 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic001G221700--Sobic003G210500 Sobic001G221700--Sobic008G187450 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic001G221700--Sobic002G290900 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G221700--Sobic001G486400 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic001G221700--Sobic004G092950 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic004G238000--Sobic010G028366 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic004G238000--Sobic010G011100 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic004G238000--Sobic009G030501 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic004G238000--Sobic003G406850 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic004G238000--Sobic003G177350 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic004G238000--Sobic006G223601 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G238000--Sobic002G147550 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic004G238000--Sobic010G174000 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic004G238000--Sobic006G223101
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.