Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G238000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRA5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G028366 - -
2 Sobic.010G011100 - -
3 Sobic.009G030501 - -
4 Sobic.003G406850 - -
5 Sobic.003G177350 - -
6 Sobic.006G223601 - -
7 Sobic.002G147550 - -
8 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
9 Sobic.006G223101 - -
10 Sobic.002G246100 - -
11 Sobic.003G404050 - -
12 Sobic.001G074900 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
13 Sobic.003G076300 - -
14 Sobic.001G299300 - -
15 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
16 Sobic.008G116800 expressed protein -
17 Sobic.009G184450 - -
18 Sobic.001G016050 - -
19 Sobic.008G053800 OsWAK24 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.001G455466 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G238000 Sobic004G238000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic004G238000--Sobic010G028366 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic004G238000--Sobic010G011100 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic004G238000--Sobic009G030501 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic004G238000--Sobic003G406850 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic004G238000--Sobic003G177350 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic004G238000--Sobic006G223601 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G238000--Sobic002G147550 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic004G238000--Sobic010G174000 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic004G238000--Sobic006G223101 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic010G028366--Sobic001G258700 Sobic010G028366--Sobic004G238000 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic010G028366--Sobic006G171801 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic010G028366--Sobic009G184450 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic010G028366--Sobic010G157600 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G028366--Sobic003G076300 Sobic010G028366--Sobic002G147550 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic010G028366--Sobic003G404050 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic010G028366--Sobic010G123650 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic010G011100--Sobic001G436450 Sobic010G011100--Sobic009G030501 Sobic010G011100--Sobic003G404050 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic010G011100--Sobic010G136700 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G011100--Sobic001G016050 Sobic010G011100--Sobic002G147550 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic010G011100--Sobic001G249800 Sobic010G011100--Sobic003G406850 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic010G011100--Sobic002G246100 Sobic009G030501--Sobic010G011100 Sobic009G030501--Sobic001G249800 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic009G030501--Sobic007G004400 Sobic009G030501--Sobic010G136700 Sobic001G162600 Sobic001G162600 Sobic009G030501--Sobic001G162600 Sobic009G030501--Sobic003G406850 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic009G030501--Sobic001G032850 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic009G030501--Sobic006G149900 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic009G030501--Sobic003G232600 Sobic003G406850--Sobic006G223601 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic002G147550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G406850--Sobic003G335100 Sobic003G406850--Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic006G223101 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic003G404050 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G406850--Sobic006G176900 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic003G177350--Sobic009G026900 Sobic003G177350--Sobic001G258700 Sobic003G177350--Sobic003G076300 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic003G177350--Sobic002G235000 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic003G177350--Sobic007G155950 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic003G177350--Sobic009G178000 Sobic003G177350--Sobic010G028366 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic003G177350--Sobic001G504300 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G177350--Sobic008G111150 Sobic006G223601--Sobic006G223101 Sobic006G223601--Sobic003G335100 Sobic006G223601--Sobic003G406850 Sobic006G223601--Sobic002G147550 Sobic006G223601--Sobic003G112100 Sobic006G223601--Sobic007G004400 Sobic006G223601--Sobic006G176900 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic006G223601--Sobic008G115200 Sobic006G223601--Sobic006G149900 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G174000--Sobic008G056000 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic010G174000--Sobic002G163400 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic010G174000--Sobic003G251000 Sobic010G174000--Sobic009G030501 Sobic010G174000--Sobic006G149900 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic010G174000--Sobic004G072600 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G174000--Sobic001G440401 Sobic010G174000--Sobic010G011100 Sobic010G174000--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G223101--Sobic001G431600
Octagon: transcription factors


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