Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G358000.4,Sobic.003G358000.2,Sobic.003G358000.6,Sobic.003G358000.1,Sobic.003G358000.5
Synonym FLN1, Sb03g040010
Functional annotation kinase, pfkB family, putative, expressed
UniProt C5XPU7
Pfam PF00294
Panther DB PTHR10584 PTHR10584:SF175
NCBI CDD KOG2855; Ribokinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54090 : fructokinase-like 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g63220.3,LOC_Os01g63220.1,LOC_Os01g63220.2 : kinase, pfkB family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026838
Brachypodium KQK10596 , KQK10597 , KQK10595
Barley -
Wheat TraesCS3D02G358800 , TraesCS3A02G365700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G358000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G111150 - -
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3 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
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8 Sobic.010G175100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
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16 Sobic.003G174500 - -
17 Sobic.010G129100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G138300 EF hand family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G187900 disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G358000 Sobic003G358000 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G358000--Sobic008G111150 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic003G358000--Sobic001G061300 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G358000--Sobic009G186300 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic003G358000--Sobic005G228650 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic003G358000--Sobic003G118000 Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic003G358000--Sobic003G058300 Sobic003G209500 Sobic003G209500 Sobic003G358000--Sobic003G209500 Sobic010G175100 Sobic010G175100 Sobic003G358000--Sobic010G175100 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G358000--Sobic002G127300 Sobic008G111150--Sobic003G118000 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic008G111150--Sobic004G212250 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic008G111150--Sobic003G177350 Sobic001G524750 Sobic001G524750 Sobic008G111150--Sobic001G524750 Sobic008G111150--Sobic009G186300 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic008G111150--Sobic001G261452 Sobic003G210500 Sobic003G210500 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Sobic002G127300--Sobic001G442000 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic002G127300--Sobic001G370800 Sobic002G127300--Sobic001G261452 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic002G127300--Sobic009G088300
Octagon: transcription factors


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