Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G146700.1
Synonym RPS2, Sb06g022550
Functional annotation NB-ARC/LRR disease resistance protein, putative, expressed
UniProt C5YC27
Pfam PF13401 PF13855
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF482
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology K13459; disease resistance protein RPS2
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26090 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43440.1 : NB-ARC/LRR disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ83570
Barley -
Wheat TraesCS2A02G384000 , TraesCS2D02G380400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G037033 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic006G146700--Sobic007G078700 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic006G146700--Sobic006G052250 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic006G146700--Sobic001G136850 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic006G146700--Sobic006G263250 Sobic008G100801 Sobic008G100801 Sobic006G146700--Sobic008G100801 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic006G146700--Sobic006G162750 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic006G146700--Sobic007G190466 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic006G146700--Sobic009G058900 Sobic003G169800 Sobic003G169800 Sobic006G146700--Sobic003G169800 Sobic007G078700--Sobic006G052250 Sobic007G078700--Sobic006G146700 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic007G078700--Sobic001G202450 Sobic007G078700--Sobic001G136850 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic007G078700--Sobic004G255550 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic007G078700--Sobic003G312900 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic007G078700--Sobic003G030450 Sobic007G078700--Sobic006G162750 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic007G078700--Sobic008G083100 Sobic006G052250--Sobic007G078700 Sobic006G052250--Sobic001G136850 Sobic006G052250--Sobic006G146700 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic006G052250--Sobic002G074900 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic006G052250--Sobic005G019250 Sobic006G052250--Sobic001G202450 Sobic006G052250--Sobic007G190466 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic006G052250--Sobic003G163000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic006G052250--Sobic005G180850 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic001G136850--Sobic009G260550 Sobic001G136850--Sobic006G052250 Sobic001G136850--Sobic006G263250 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G136850--Sobic003G169700 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic001G136850--Sobic001G093400 Sobic001G136850--Sobic006G146700 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic001G136850--Sobic004G276600 Sobic001G136850--Sobic007G078700 Sobic001G136850--Sobic002G074900 Sobic006G263250--Sobic001G136850 Sobic006G263250--Sobic006G146700 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G263250--Sobic006G059150 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G263250--Sobic001G118050 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G263250--Sobic006G100150 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G039750 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic006G263250--Sobic001G470700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic009G260550 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic008G100801--Sobic008G100900 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic008G100801--Sobic004G127766 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic008G100801--Sobic004G133201 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic008G100801--Sobic010G169950 Sobic008G100801--Sobic004G276600 Sobic008G100801--Sobic007G190466 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G100801--Sobic008G115200 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic008G100801--Sobic007G090433 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic008G100801--Sobic001G037033 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic006G162750--Sobic001G094550 Sobic006G162750--Sobic003G169800 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic006G162750--Sobic001G523150 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic006G162750--Sobic006G279600 Sobic006G162750--Sobic001G037033 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic006G162750--Sobic003G253100 Sobic006G162750--Sobic007G190466 Sobic006G162750--Sobic008G100801 Sobic006G162750--Sobic006G146700 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic007G190466--Sobic007G190600 Sobic007G190466--Sobic004G276600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic007G190466--Sobic001G420150 Sobic007G190466--Sobic006G059150 Sobic007G190466--Sobic004G127766 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic007G190466--Sobic007G116300 Sobic007G190466--Sobic007G090433 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G190466--Sobic001G431600 Sobic007G190466--Sobic008G100801 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic009G058900--Sobic007G054200 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic009G058900--Sobic008G156800 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic009G058900--Sobic007G046700 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic009G058900--Sobic006G258100 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic009G058900--Sobic003G169550 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic009G058900--Sobic004G129400 Sobic009G058900--Sobic004G133201 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic009G058900--Sobic003G069400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic009G058900--Sobic001G323101 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic003G169800--Sobic007G113000 Sobic003G169800--Sobic003G169700 Sobic003G169800--Sobic009G260550 Sobic003G169800--Sobic006G162750 Sobic003G169800--Sobic001G093400 Sobic003G169800--Sobic006G279600 Sobic003G169800--Sobic008G100801 Sobic003G169800--Sobic006G100150 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic003G169800--Sobic002G220400
Octagon: transcription factors


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