Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G197900.2
Synonym Sb06g027010
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RF76
Pfam -
Panther DB PTHR34197 PTHR34197:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35200 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50176.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021606 , Zm00025a056725
Brachypodium KQK00841
Barley HORVU6Hr1G067120.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.006G197900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G081701 - K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.002G223650 - -
3 Sobic.006G276801 - -
4 Sobic.009G177750 - -
5 Sobic.002G266500 - -
6 Sobic.004G075250 - -
7 Sobic.003G250160 - -
8 Sobic.004G258000 expressed protein -
9 Sobic.001G467400 expressed protein -
10 Sobic.003G274100 THION44 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.001G197050 - -
12 Sobic.002G011300 - -
13 Sobic.010G187700 GRAM and C2 domains containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G255900 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
15 Sobic.009G110333 - -
16 Sobic.005G112500 - -
17 Sobic.003G320000 expressed protein -
18 Sobic.007G042800 expressed protein -
19 Sobic.002G283200 expressed protein -
20 Sobic.006G169700 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant


Gene co-expression network
sample Sobic006G197900 Sobic006G197900 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic006G197900--Sobic007G081701 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic006G197900--Sobic002G223650 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic006G197900--Sobic006G276801 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic006G197900--Sobic009G177750 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic006G197900--Sobic002G266500 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic006G197900--Sobic004G075250 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic006G197900--Sobic003G250160 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic006G197900--Sobic004G258000 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic006G197900--Sobic001G467400 Sobic007G081701--Sobic003G250160 Sobic007G081701--Sobic009G177750 Sobic007G081701--Sobic006G276801 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic007G081701--Sobic001G197050 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic007G081701--Sobic005G112500 Sobic007G081701--Sobic001G467400 Sobic007G081701--Sobic004G258000 Sobic004G255900 Sobic004G255900 Sobic007G081701--Sobic004G255900 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic007G081701--Sobic002G011300 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic004G075250 Sobic006G276801--Sobic004G258000 Sobic006G276801--Sobic007G081701 Sobic006G276801--Sobic003G250160 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic005G112500 Sobic006G276801--Sobic002G011300 Sobic006G276801--Sobic009G177750 Sobic006G276801--Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic002G223650 Sobic009G177750--Sobic003G250160 Sobic009G177750--Sobic007G081701 Sobic009G177750--Sobic001G197050 Sobic009G177750--Sobic006G276801 Sobic009G177750--Sobic001G467400 Sobic009G177750--Sobic004G255900 Sobic009G177750--Sobic005G112500 Sobic003G320000 Sobic003G320000 Sobic009G177750--Sobic003G320000 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic009G177750--Sobic002G000200 Sobic002G266500--Sobic009G110333 Sobic002G266500--Sobic002G011300 Sobic002G266500--Sobic005G112500 Sobic002G266500--Sobic004G258000 Sobic002G266500--Sobic006G276801 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic002G266500--Sobic004G050900 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic002G266500--Sobic003G133201 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic002G266500--Sobic009G110700 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G266500--Sobic008G169101 Sobic004G075250--Sobic001G467400 Sobic004G075250--Sobic006G276801 Sobic004G075250--Sobic002G223650 Sobic004G075250--Sobic004G258000 Sobic004G075250--Sobic003G250160 Sobic004G075250--Sobic007G081701 Sobic004G075250--Sobic009G177750 Sobic004G075250--Sobic003G274100 Sobic004G075250--Sobic002G011300 Sobic003G250160--Sobic007G081701 Sobic003G250160--Sobic009G177750 Sobic003G250160--Sobic001G197050 Sobic003G250160--Sobic006G276801 Sobic003G250160--Sobic001G467400 Sobic003G250160--Sobic004G255900 Sobic003G250160--Sobic005G112500 Sobic003G250160--Sobic002G223650 Sobic003G250160--Sobic004G258000 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic001G467400--Sobic003G250160 Sobic001G467400--Sobic004G075250 Sobic001G467400--Sobic007G081701 Sobic001G467400--Sobic006G276801 Sobic001G467400--Sobic009G177750 Sobic001G467400--Sobic002G223650 Sobic001G467400--Sobic004G258000 Sobic001G467400--Sobic003G274100 Sobic001G467400--Sobic001G197050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.