Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G232100.1
Synonym Sb06g029990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YG42
Pfam -
Panther DB PTHR36143 PTHR36143:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54370.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055068 , Zm00025a057145 , Zm00025a020947 , Zm00025a011884 , Zm00025a009623
Brachypodium KQJ84845
Barley -
Wheat TraesCS2A02G527500 , TraesCS2D02G530300 , TraesCS2B02G558200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G142800 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
2 Sobic.002G153600 expressed protein -
3 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
4 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.003G186066 - -
6 Sobic.003G119200 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G260250 - -
8 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
9 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
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11 Sobic.004G310800 zinc finger protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.009G094100 - -
14 Sobic.004G127733 - -
15 Sobic.003G251000 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.007G103200 - -
17 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
18 Sobic.002G154450 - -
19 Sobic.009G229500 expressed protein -
20 Sobic.003G268100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic006G232100--Sobic003G142800 Sobic002G153600 Sobic002G153600 Sobic006G232100--Sobic002G153600 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic006G232100--Sobic010G132400 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic006G232100--Sobic004G130500 Sobic003G186066 Sobic003G186066 Sobic006G232100--Sobic003G186066 Sobic003G119200 Sobic003G119200 Sobic006G232100--Sobic003G119200 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic006G232100--Sobic004G260250 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic006G232100--Sobic005G176300 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic006G232100--Sobic010G174000 Sobic003G142800--Sobic010G132400 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic003G142800--Sobic005G154600 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic003G142800--Sobic004G332200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G142800--Sobic004G276600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G142800--Sobic006G035350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic003G142800--SobicK031900 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic003G142800--Sobic001G420150 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic003G142800--Sobic001G423200 Sobic003G142800--Sobic004G260250 Sobic002G153600--Sobic006G232100 Sobic002G153600--Sobic003G142800 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic002G153600--Sobic006G217400 Sobic002G153600--Sobic004G130500 Sobic002G153600--Sobic006G035350 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic002G153600--Sobic004G127733 SobicK031400 SobicK031400 Sobic002G153600--SobicK031400 Sobic002G153600--Sobic004G260250 Sobic002G153600--Sobic010G132400 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic010G132400--Sobic010G136700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic006G035350 Sobic010G132400--Sobic005G154600 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic004G276600 Sobic010G132400--Sobic004G127733 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic002G154450 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic010G132400--Sobic008G115200 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic004G130500--Sobic009G209650 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic004G130500--Sobic010G143700 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic004G130500--Sobic007G103200 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic004G130500--Sobic003G268100 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic004G130500--Sobic007G116150 Sobic004G130500--Sobic006G035350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic004G130500--Sobic009G094100 SobicK032400 SobicK032400 Sobic004G130500--SobicK032400 SobicK032350 SobicK032350 Sobic004G130500--SobicK032350 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G186066--Sobic008G116800 Sobic010G229300 Sobic010G229300 Sobic003G186066--Sobic010G229300 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G186066--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G186066--Sobic004G129400 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G186066--Sobic002G147550 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G186066--Sobic008G156800 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic003G186066--Sobic010G053700 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic003G186066--Sobic005G021400 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic003G186066--Sobic003G396050 Sobic003G119200--Sobic006G232100 Sobic003G119200--Sobic003G142800 Sobic004G270100 Sobic004G270100 Sobic003G119200--Sobic004G270100 Sobic003G119200--Sobic010G132400 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic003G119200--Sobic003G105200 Sobic006G212200 Sobic006G212200 Sobic003G119200--Sobic006G212200 Sobic003G119200--Sobic005G176300 Sobic007G136500 Sobic007G136500 Sobic003G119200--Sobic007G136500 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic003G119200--Sobic006G094900 Sobic004G260250--Sobic004G127733 Sobic004G260250--Sobic002G154450 Sobic004G260250--Sobic007G103200 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic004G260250--Sobic010G052100 Sobic004G260250--Sobic006G035350 Sobic004G260250--Sobic006G176900 Sobic004G260250--Sobic005G176300 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G260250--Sobic003G244250 Sobic004G260250--Sobic009G094100 Sobic005G176300--Sobic009G094100 Sobic005G176300--Sobic010G052100 Sobic005G176300--Sobic003G268100 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic005G176300--Sobic004G072600 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic005G176300--Sobic003G173200 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic005G176300--Sobic003G251000 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G176300--Sobic010G247750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic005G176300--Sobic006G037800 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic005G176300--Sobic004G127350 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G174000--Sobic008G056000 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic010G174000--Sobic002G163400 Sobic010G174000--Sobic003G251000 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic010G174000--Sobic009G030501 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic010G174000--Sobic006G149900 Sobic010G174000--Sobic004G072600 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G174000--Sobic001G440401 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic010G174000--Sobic010G011100 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic010G174000--Sobic006G223601
Octagon: transcription factors


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