Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G148266.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RAW6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13480.1 : glutaredoxin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022796
Brachypodium KQK03477
Barley HORVU3Hr1G057240.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G064700 gibberellin 3-beta-dioxygenase 2-2, putative, expressed K04124: gibberellin 3beta-dioxygenase
2 Sobic.010G068051 - -
3 Sobic.002G028901 - -
4 Sobic.007G191150 - -
5 Sobic.001G298200 - -
6 Sobic.002G317900 expressed protein -
7 Sobic.003G244401 - -
8 Sobic.003G196500 - -
9 Sobic.003G203900 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
10 Sobic.007G171300 - -
11 Sobic.003G247100 aspartic proteinase oryzasin-1 precursor, putative, expressed K08245: phytepsin
12 Sobic.003G063801 - -
13 Sobic.001G135000 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G196600 expressed protein -
15 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G122700 expressed protein -
17 Sobic.005G116250 - -
18 Sobic.003G323400 - -
19 Sobic.006G192000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma


Gene co-expression network
sample Sobic007G148266 Sobic007G148266 Sobic009G064700 Sobic009G064700 Sobic007G148266--Sobic009G064700 Sobic010G068051 Sobic010G068051 Sobic007G148266--Sobic010G068051 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic007G148266--Sobic002G028901 Sobic007G191150 Sobic007G191150 Sobic007G148266--Sobic007G191150 Sobic001G298200 Sobic001G298200 Sobic007G148266--Sobic001G298200 Sobic002G317900 Sobic002G317900 Sobic007G148266--Sobic002G317900 Sobic003G244401 Sobic003G244401 Sobic007G148266--Sobic003G244401 Sobic003G196500 Sobic003G196500 Sobic007G148266--Sobic003G196500 Sobic003G203900 Sobic003G203900 Sobic007G148266--Sobic003G203900 Sobic009G064700--Sobic002G028901 Sobic009G064700--Sobic001G298200 Sobic009G064700--Sobic007G148266 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic009G064700--Sobic001G495550 Sobic009G064700--Sobic010G068051 Sobic004G147300 Sobic004G147300 Sobic009G064700--Sobic004G147300 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic009G064700--Sobic003G063801 Sobic009G064700--Sobic007G191150 Sobic010G185350 Sobic010G185350 Sobic009G064700--Sobic010G185350 Sobic010G068051--Sobic001G298200 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic010G068051--Sobic001G135000 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic010G068051--Sobic007G171300 Sobic010G068051--Sobic007G148266 Sobic010G068051--Sobic009G064700 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic010G068051--Sobic001G463700 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic010G068051--Sobic006G031866 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic010G068051--Sobic003G193400 Sobic007G141420 Sobic007G141420 Sobic010G068051--Sobic007G141420 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic002G028901--Sobic005G035400 Sobic002G028901--Sobic007G191150 Sobic002G028901--Sobic004G147300 Sobic002G028901--Sobic009G064700 Sobic002G028901--Sobic001G495550 Sobic007G121800 Sobic007G121800 Sobic002G028901--Sobic007G121800 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic002G028901--Sobic003G333300 Sobic006G089601 Sobic006G089601 Sobic002G028901--Sobic006G089601 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic002G028901--Sobic010G263151 Sobic007G191150--Sobic010G263151 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic007G191150--Sobic003G267400 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic007G191150--Sobic008G110151 Sobic007G191150--Sobic003G244401 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic007G191150--Sobic001G209000 Sobic007G191150--Sobic006G089601 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic007G191150--Sobic006G196800 Sobic007G191150--Sobic007G121800 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic007G191150--Sobic003G419100 Sobic001G298200--Sobic010G068051 Sobic001G298200--Sobic009G064700 Sobic001G298200--Sobic006G031866 Sobic001G298200--Sobic001G463700 Sobic001G298200--Sobic001G135000 Sobic001G298200--Sobic002G028901 Sobic001G298200--Sobic007G171300 Sobic004G147600 Sobic004G147600 Sobic001G298200--Sobic004G147600 Sobic001G298200--Sobic003G193400 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic002G317900--Sobic003G198850 SobicK004201 SobicK004201 Sobic002G317900--SobicK004201 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic002G317900--Sobic003G257650 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic002G317900--Sobic010G226100 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic002G317900--Sobic006G241500 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic002G317900--Sobic002G367000 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic002G317900--Sobic004G115950 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic002G317900--Sobic003G383000 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic002G317900--Sobic003G432400 Sobic003G244401--Sobic007G191150 Sobic003G244401--Sobic007G121800 Sobic003G244401--Sobic008G110151 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G244401--Sobic003G254400 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic003G244401--Sobic003G008400 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G244401--Sobic003G318600 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G244401--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G244401--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G244401--Sobic010G064050 Sobic010G079150 Sobic010G079150 Sobic003G196500--Sobic010G079150 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic003G196500--Sobic006G110101 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic003G196500--Sobic001G369550 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic003G196500--Sobic008G052700 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G196500--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G196500--Sobic009G225250 Sobic003G196500--Sobic003G063801 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic003G196500--Sobic002G250700 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic003G196500--Sobic009G163000 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic003G203900--Sobic005G102600 Sobic002G320300 Sobic002G320300 Sobic003G203900--Sobic002G320300 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic003G203900--Sobic001G197700 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic003G203900--Sobic001G122700 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic003G203900--Sobic003G049000 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic003G203900--Sobic010G069700 Sobic003G203900--Sobic009G064700 Sobic006G151300 Sobic006G151300 Sobic003G203900--Sobic006G151300 Sobic004G172000 Sobic004G172000 Sobic003G203900--Sobic004G172000
Octagon: transcription factors


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