Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G020700.1
Synonym Sb08g001830, MIF2
Functional annotation ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed
UniProt C5YQS1
Pfam PF04770
Panther DB PTHR31948
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28917 : mini zinc finger 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g03420.1 : ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028995 , Zm00025a053744
Brachypodium KQJ98684
Barley HORVU1Hr1G091470.1 , HORVU3Hr1G096990.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G020700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G112250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G020700 Sobic008G020700 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic008G020700--Sobic002G077600 Sobic001G037800 Sobic001G037800 Sobic008G020700--Sobic001G037800 Sobic009G013400 Sobic009G013400 Sobic008G020700--Sobic009G013400 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic008G020700--Sobic007G049400 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic008G020700--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic008G020700--Sobic009G245750 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic008G020700--Sobic005G112066 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic008G020700--Sobic007G083300 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic008G020700--Sobic003G247700 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic002G077600--Sobic007G070700 Sobic002G077600--Sobic007G083300 Sobic002G077600--Sobic001G253501 Sobic002G077600--Sobic009G245750 Sobic002G077600--Sobic003G247700 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic002G077600--Sobic001G112250 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic002G077600--Sobic009G001600 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic002G077600--Sobic002G211700 Sobic002G077600--Sobic007G049400 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic001G037800--Sobic009G116500 Sobic001G297800 Sobic001G297800 Sobic001G037800--Sobic001G297800 Sobic002G028100 Sobic002G028100 Sobic001G037800--Sobic002G028100 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic001G037800--Sobic002G089400 Sobic007G034900 Sobic007G034900 Sobic001G037800--Sobic007G034900 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic001G037800--Sobic002G367600 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic001G037800--Sobic002G338600 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic001G037800--Sobic010G200200 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic001G037800--Sobic007G205100 Sobic003G153500 Sobic003G153500 Sobic009G013400--Sobic003G153500 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic009G013400--Sobic007G082900 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic009G013400--Sobic005G187100 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic009G013400--Sobic008G013100 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic009G013400--Sobic003G323000 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic009G013400--Sobic004G254400 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic009G013400--Sobic001G394100 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic009G013400--Sobic009G022700 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic009G013400--Sobic008G013000 Sobic007G049400--Sobic005G112066 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic007G049400--Sobic002G077500 Sobic007G049400--Sobic002G077600 Sobic007G049400--Sobic001G253501 Sobic007G049400--Sobic009G245750 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic007G049400--Sobic005G140400 Sobic007G049400--Sobic007G070700 Sobic007G049400--Sobic007G083300 Sobic007G049400--Sobic001G112250 Sobic001G253501--Sobic009G245750 Sobic001G253501--Sobic003G247700 Sobic001G253501--Sobic009G001600 Sobic001G253501--Sobic002G077600 Sobic001G253501--Sobic007G070700 Sobic001G253501--Sobic001G112250 Sobic001G253501--Sobic002G211700 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic001G253501--Sobic008G103066 Sobic001G253501--Sobic007G049400 Sobic009G245750--Sobic001G253501 Sobic009G245750--Sobic003G247700 Sobic009G245750--Sobic009G001600 Sobic009G245750--Sobic002G077600 Sobic009G245750--Sobic007G070700 Sobic009G245750--Sobic001G112250 Sobic009G245750--Sobic002G211700 Sobic009G245750--Sobic008G103066 Sobic009G245750--Sobic007G049400 Sobic005G112066--Sobic002G077500 Sobic005G112066--Sobic007G049400 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic005G112066--Sobic001G326000 Sobic005G112066--Sobic005G140400 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G112066--Sobic002G091800 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic005G112066--Sobic009G186400 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic005G112066--Sobic007G156300 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic005G112066--Sobic002G344900 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic005G112066--Sobic006G031600 Sobic007G083300--Sobic007G070700 Sobic007G083300--Sobic002G077600 Sobic007G083300--Sobic003G247700 SobicK043500 SobicK043500 Sobic007G083300--SobicK043500 Sobic007G083300--Sobic002G211700 Sobic007G083300--Sobic001G253501 Sobic007G083300--Sobic009G245750 Sobic007G083300--Sobic009G001600 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic007G083300--Sobic001G535900 Sobic003G247700--Sobic002G211700 Sobic003G247700--Sobic009G001600 Sobic003G247700--Sobic001G535900 Sobic003G247700--Sobic007G070700 Sobic003G247700--Sobic009G245750 Sobic003G247700--Sobic001G253501 Sobic003G247700--Sobic002G077600 Sobic003G247700--Sobic007G083300 Sobic003G247700--Sobic008G103066
Octagon: transcription factors


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