Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G111000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PD51
Pfam -
Panther DB PTHR33170 PTHR33170:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g47030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G218800 - -
2 Sobic.009G120850 - -
3 Sobic.006G052650 - -
4 Sobic.007G080660 - -
5 Sobic.002G373500 OsFBX152 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G230300 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
7 Sobic.002G191200 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G087432 - -
9 Sobic.005G145000 expressed protein -
10 Sobic.005G008500 expressed protein -
11 Sobic.009G211100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.008G091100 - -
13 Sobic.008G174400 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
15 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
16 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.005G083932 - -
19 Sobic.003G156800 - -
20 Sobic.010G127500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G111000 Sobic008G111000 Sobic006G218800 Sobic006G218800 Sobic008G111000--Sobic006G218800 Sobic009G120850 Sobic009G120850 Sobic008G111000--Sobic009G120850 Sobic006G052650 Sobic006G052650 Sobic008G111000--Sobic006G052650 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic008G111000--Sobic007G080660 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic008G111000--Sobic002G373500 Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic008G111000--Sobic004G230300 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic008G111000--Sobic002G191200 Sobic004G087432 Sobic004G087432 Sobic008G111000--Sobic004G087432 Sobic005G145000 Sobic005G145000 Sobic008G111000--Sobic005G145000 Sobic005G057201 Sobic005G057201 Sobic006G218800--Sobic005G057201 Sobic005G008500 Sobic005G008500 Sobic006G218800--Sobic005G008500 Sobic006G218800--Sobic006G052650 Sobic006G218800--Sobic007G080660 Sobic008G120000 Sobic008G120000 Sobic006G218800--Sobic008G120000 Sobic005G081700 Sobic005G081700 Sobic006G218800--Sobic005G081700 Sobic006G218800--Sobic005G145000 Sobic006G218800--Sobic002G191200 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic006G218800--Sobic002G288800 Sobic003G409850 Sobic003G409850 Sobic009G120850--Sobic003G409850 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic009G120850--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic009G120850--Sobic005G083932 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic009G120850--Sobic008G174400 Sobic009G120850--Sobic002G191200 Sobic009G120850--Sobic002G373500 Sobic006G052650--Sobic002G373500 Sobic006G052650--Sobic001G317900 Sobic006G052650--Sobic005G083932 Sobic006G052650--Sobic008G174400 Sobic006G052650--Sobic002G191200 Sobic006G052650--Sobic005G145000 Sobic007G080660--Sobic002G191200 Sobic007G080660--Sobic001G317900 Sobic007G080660--Sobic005G083932 Sobic007G080660--Sobic008G174400 Sobic007G080660--Sobic002G373500 Sobic010G127500 Sobic010G127500 Sobic007G080660--Sobic010G127500 Sobic002G373500--Sobic008G174400 Sobic002G373500--Sobic001G317900 Sobic002G373500--Sobic005G083932 Sobic002G373500--Sobic002G191200 Sobic002G373500--Sobic010G127500 Sobic002G373500--Sobic007G080660 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic004G230300--Sobic001G060732 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic004G230300--Sobic004G116900 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G230300--Sobic007G223250 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic004G230300--Sobic006G123800 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G230300--Sobic002G014900 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic004G230300--Sobic001G365332 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic004G230300--Sobic003G393600 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic004G230300--Sobic002G150032 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic004G230300--Sobic010G132200 Sobic002G191200--Sobic001G317900 Sobic002G191200--Sobic005G083932 Sobic002G191200--Sobic008G174400 Sobic002G191200--Sobic002G373500 Sobic002G191200--Sobic007G080660 Sobic002G191200--Sobic010G127500 Sobic008G091100 Sobic008G091100 Sobic004G087432--Sobic008G091100 Sobic004G087432--Sobic001G317900 Sobic004G087432--Sobic005G083932 Sobic004G087432--Sobic008G174400 Sobic004G087432--Sobic002G191200 Sobic004G087432--Sobic002G373500 Sobic005G145000--Sobic001G317900 Sobic005G145000--Sobic005G083932 Sobic005G145000--Sobic008G174400 Sobic005G145000--Sobic002G191200 Sobic005G145000--Sobic002G373500 Sobic005G145000--Sobic010G127500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.