Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G008500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PPJ3
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g18070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G138600 DIE2/ALG10 family, putative, expressed K03850: alpha-1,2-glucosyltransferase
2 Sobic.006G218800 - -
3 Sobic.008G120000 - -
4 Sobic.001G098100 cyclin, putative, expressed K06634: cyclin H
5 Sobic.009G038600 GA20663-PA, putative, expressed -
6 Sobic.003G182700 protein phosphatase 2C containing protein, expressed -
7 Sobic.008G111000 expressed protein -
8 Sobic.002G079200 EF hand family protein, putative, expressed K02183: calmodulin
9 Sobic.002G288800 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
10 Sobic.009G211100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.001G350400 steroid binding protein, putative, expressed K13484: 5-hydroxyisourate hydrolase / 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase
12 Sobic.010G162200 serine/threonine-protein kinase 19, putative, expressed K08880: serine/threonine kinase 19
13 Sobic.004G197700 expressed protein -
14 Sobic.002G174000 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G057201 - -
16 Sobic.005G145000 expressed protein -
17 Sobic.002G373500 OsFBX152 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G260900 - -
19 Sobic.003G156800 - -
20 Sobic.003G118650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G008500 Sobic005G008500 Sobic006G138600 Sobic006G138600 Sobic005G008500--Sobic006G138600 Sobic006G218800 Sobic006G218800 Sobic005G008500--Sobic006G218800 Sobic008G120000 Sobic008G120000 Sobic005G008500--Sobic008G120000 Sobic001G098100 Sobic001G098100 Sobic005G008500--Sobic001G098100 Sobic009G038600 Sobic009G038600 Sobic005G008500--Sobic009G038600 Sobic003G182700 Sobic003G182700 Sobic005G008500--Sobic003G182700 Sobic008G111000 Sobic008G111000 Sobic005G008500--Sobic008G111000 Sobic002G079200 Sobic002G079200 Sobic005G008500--Sobic002G079200 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic005G008500--Sobic002G288800 Sobic006G138600--Sobic001G098100 Sobic010G125700 Sobic010G125700 Sobic006G138600--Sobic010G125700 Sobic006G138600--Sobic005G008500 Sobic006G027200 Sobic006G027200 Sobic006G138600--Sobic006G027200 Sobic006G138600--Sobic009G038600 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic006G138600--Sobic001G408500 Sobic010G051200 Sobic010G051200 Sobic006G138600--Sobic010G051200 Sobic006G223200 Sobic006G223200 Sobic006G138600--Sobic006G223200 Sobic007G118400 Sobic007G118400 Sobic006G138600--Sobic007G118400 Sobic005G057201 Sobic005G057201 Sobic006G218800--Sobic005G057201 Sobic006G218800--Sobic005G008500 Sobic006G052650 Sobic006G052650 Sobic006G218800--Sobic006G052650 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic006G218800--Sobic007G080660 Sobic006G218800--Sobic008G120000 Sobic005G081700 Sobic005G081700 Sobic006G218800--Sobic005G081700 Sobic005G145000 Sobic005G145000 Sobic006G218800--Sobic005G145000 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic006G218800--Sobic002G191200 Sobic006G218800--Sobic002G288800 Sobic008G120000--Sobic006G218800 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic008G120000--Sobic004G112800 Sobic008G120000--Sobic005G008500 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic008G120000--Sobic003G089700 Sobic009G211100 Sobic009G211100 Sobic008G120000--Sobic009G211100 Sobic002G416250 Sobic002G416250 Sobic008G120000--Sobic002G416250 Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic008G120000--Sobic001G095800 Sobic003G156800 Sobic003G156800 Sobic008G120000--Sobic003G156800 Sobic008G120000--Sobic006G138600 Sobic001G098100--Sobic006G138600 Sobic005G056500 Sobic005G056500 Sobic001G098100--Sobic005G056500 Sobic001G176700 Sobic001G176700 Sobic001G098100--Sobic001G176700 Sobic001G098100--Sobic006G027200 Sobic010G038600 Sobic010G038600 Sobic001G098100--Sobic010G038600 Sobic001G098100--Sobic007G118400 Sobic005G040500 Sobic005G040500 Sobic001G098100--Sobic005G040500 Sobic003G223300 Sobic003G223300 Sobic001G098100--Sobic003G223300 Sobic001G098100--Sobic010G125700 Sobic009G038600--Sobic006G223200 Sobic009G038600--Sobic006G138600 Sobic002G430400 Sobic002G430400 Sobic009G038600--Sobic002G430400 Sobic009G037000 Sobic009G037000 Sobic009G038600--Sobic009G037000 Sobic009G038600--Sobic010G038600 Sobic003G077600 Sobic003G077600 Sobic009G038600--Sobic003G077600 Sobic009G038600--Sobic005G008500 Sobic009G184800 Sobic009G184800 Sobic009G038600--Sobic009G184800 Sobic008G040000 Sobic008G040000 Sobic009G038600--Sobic008G040000 Sobic010G162200 Sobic010G162200 Sobic003G182700--Sobic010G162200 Sobic003G182501 Sobic003G182501 Sobic003G182700--Sobic003G182501 Sobic003G182700--Sobic005G008500 Sobic003G290800 Sobic003G290800 Sobic003G182700--Sobic003G290800 Sobic004G197700 Sobic004G197700 Sobic003G182700--Sobic004G197700 Sobic003G182700--Sobic001G176700 Sobic003G182600 Sobic003G182600 Sobic003G182700--Sobic003G182600 Sobic003G182700--Sobic006G138600 Sobic007G080780 Sobic007G080780 Sobic003G182700--Sobic007G080780 Sobic008G111000--Sobic006G218800 Sobic009G120850 Sobic009G120850 Sobic008G111000--Sobic009G120850 Sobic008G111000--Sobic006G052650 Sobic008G111000--Sobic007G080660 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic008G111000--Sobic002G373500 Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic008G111000--Sobic004G230300 Sobic008G111000--Sobic002G191200 Sobic004G087432 Sobic004G087432 Sobic008G111000--Sobic004G087432 Sobic008G111000--Sobic005G145000 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic002G079200--Sobic001G317900 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic002G079200--Sobic008G174400 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic002G079200--Sobic005G083932 Sobic002G079200--Sobic002G373500 Sobic002G079200--Sobic002G191200 Sobic002G079200--Sobic007G080660 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic002G288800--Sobic001G260900 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic002G288800--Sobic007G115050 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic002G288800--Sobic002G174000 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic002G288800--Sobic005G134301 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic002G288800--Sobic008G139100 Sobic002G288800--Sobic005G083932 Sobic002G288800--Sobic001G317900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.