Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G038600.1,Sobic.009G038600.5,Sobic.009G038600.7,Sobic.009G038600.8,Sobic.009G038600.2
Synonym Sb09g003260
Functional annotation GA20663-PA, putative, expressed
UniProt A0A1B6P6K0 , A0A1Z5R205 , A0A1B6P6Q8
Pfam PF10294
Panther DB PTHR14614 PTHR14614:SF31
NCBI CDD KOG2497; Predicted methyltransferase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27400 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g05130.1 : GA20663-PA, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055371
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G018700.1 , HORVU1Hr1G018700.3 , HORVU1Hr1G018700.2 , HORVU1Hr1G018700.5 , HORVU1Hr1G018700.4 , HORVU1Hr1G018700.7 , HORVU1Hr1G018700.6 , HORVU1Hr1G018700.9 , HORVU1Hr1G018700.8 , HORVU1Hr1G018700.15 , HORVU1Hr1G018700.14 , HORVU1Hr1G018700.17 , HORVU1Hr1G018700.16 , HORVU1Hr1G018700.11 , HORVU1Hr1G018700.10 , HORVU1Hr1G018700.13 , HORVU1Hr1G018700.12 , HORVU1Hr1G018700.19 , HORVU1Hr1G018700.18
Wheat TraesCS1B02G104400 , TraesCS1D02G087500 , TraesCS1D02G087500
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G038600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G223200 expressed protein K19025: AP5Z1, AP-5 complex subunit zeta-1
2 Sobic.006G138600 DIE2/ALG10 family, putative, expressed K03850: alpha-1,2-glucosyltransferase
3 Sobic.002G430400 - -
4 Sobic.009G037000 agenet domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G038600 expressed protein -
6 Sobic.003G077600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K10140: DNA damage-binding protein 2
7 Sobic.005G008500 expressed protein -
8 Sobic.009G184800 ribosomal protein L11 methyltransferase-related, putative, expressed -
9 Sobic.008G040000 PPR repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.001G098100 cyclin, putative, expressed K06634: cyclin H
11 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
12 Sobic.006G111800 expressed protein K14827: IPI1, pre-rRNA-processing protein IPI1
13 Sobic.004G024700 RNA polymerase II transcription factor B subunit 4, putative, expressed K03143: TFIIH3, GTF2H3, transcription initiation factor TFIIH subunit 3
14 Sobic.008G140000 expressed protein -
15 Sobic.004G352600 expressed protein -
16 Sobic.004G040300 - -
17 Sobic.003G223300 chitinase domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed K17525: chitinase domain-containing protein 1
18 Sobic.008G038400 expressed protein -
19 Sobic.002G181400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13175: THO complex subunit 6
20 Sobic.010G249900 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G038600 Sobic009G038600 Sobic006G223200 Sobic006G223200 Sobic009G038600--Sobic006G223200 Sobic006G138600 Sobic006G138600 Sobic009G038600--Sobic006G138600 Sobic002G430400 Sobic002G430400 Sobic009G038600--Sobic002G430400 Sobic009G037000 Sobic009G037000 Sobic009G038600--Sobic009G037000 Sobic010G038600 Sobic010G038600 Sobic009G038600--Sobic010G038600 Sobic003G077600 Sobic003G077600 Sobic009G038600--Sobic003G077600 Sobic005G008500 Sobic005G008500 Sobic009G038600--Sobic005G008500 Sobic009G184800 Sobic009G184800 Sobic009G038600--Sobic009G184800 Sobic008G040000 Sobic008G040000 Sobic009G038600--Sobic008G040000 Sobic006G223200--Sobic009G037000 Sobic006G223200--Sobic009G038600 Sobic005G028600 Sobic005G028600 Sobic006G223200--Sobic005G028600 Sobic008G038400 Sobic008G038400 Sobic006G223200--Sobic008G038400 Sobic004G024700 Sobic004G024700 Sobic006G223200--Sobic004G024700 Sobic004G319900 Sobic004G319900 Sobic006G223200--Sobic004G319900 Sobic001G332700 Sobic001G332700 Sobic006G223200--Sobic001G332700 Sobic006G279200 Sobic006G279200 Sobic006G223200--Sobic006G279200 Sobic006G223200--Sobic006G138600 Sobic001G098100 Sobic001G098100 Sobic006G138600--Sobic001G098100 Sobic010G125700 Sobic010G125700 Sobic006G138600--Sobic010G125700 Sobic006G138600--Sobic005G008500 Sobic006G027200 Sobic006G027200 Sobic006G138600--Sobic006G027200 Sobic006G138600--Sobic009G038600 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic006G138600--Sobic001G408500 Sobic010G051200 Sobic010G051200 Sobic006G138600--Sobic010G051200 Sobic006G138600--Sobic006G223200 Sobic007G118400 Sobic007G118400 Sobic006G138600--Sobic007G118400 Sobic009G241966 Sobic009G241966 Sobic002G430400--Sobic009G241966 Sobic002G430400--Sobic009G038600 Sobic002G181400 Sobic002G181400 Sobic002G430400--Sobic002G181400 Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic002G430400--Sobic006G213200 Sobic003G213800 Sobic003G213800 Sobic002G430400--Sobic003G213800 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic002G430400--Sobic004G046001 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic002G430400--Sobic004G250100 Sobic006G197500 Sobic006G197500 Sobic002G430400--Sobic006G197500 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic002G430400--Sobic001G261537 Sobic009G037000--Sobic008G038400 Sobic009G037000--Sobic004G024700 Sobic009G037000--Sobic006G223200 Sobic007G029600 Sobic007G029600 Sobic009G037000--Sobic007G029600 Sobic006G186400 Sobic006G186400 Sobic009G037000--Sobic006G186400 Sobic010G063300 Sobic010G063300 Sobic009G037000--Sobic010G063300 Sobic003G001400 Sobic003G001400 Sobic009G037000--Sobic003G001400 Sobic007G147400 Sobic007G147400 Sobic009G037000--Sobic007G147400 Sobic003G365700 Sobic003G365700 Sobic009G037000--Sobic003G365700 Sobic005G056500 Sobic005G056500 Sobic010G038600--Sobic005G056500 Sobic003G326500 Sobic003G326500 Sobic010G038600--Sobic003G326500 Sobic003G050700 Sobic003G050700 Sobic010G038600--Sobic003G050700 Sobic003G223300 Sobic003G223300 Sobic010G038600--Sobic003G223300 Sobic005G008600 Sobic005G008600 Sobic010G038600--Sobic005G008600 Sobic001G503200 Sobic001G503200 Sobic010G038600--Sobic001G503200 Sobic010G038600--Sobic001G098100 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic010G038600--Sobic003G183466 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic010G038600--Sobic002G236500 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic003G077600--Sobic006G141100 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic003G077600--Sobic010G056100 Sobic003G077600--Sobic009G038600 Sobic001G167800 Sobic001G167800 Sobic003G077600--Sobic001G167800 Sobic003G077600--Sobic004G046001 Sobic008G140000 Sobic008G140000 Sobic003G077600--Sobic008G140000 Sobic003G077600--Sobic006G213200 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic003G077600--Sobic002G139700 Sobic007G129100 Sobic007G129100 Sobic003G077600--Sobic007G129100 Sobic005G008500--Sobic006G138600 Sobic006G218800 Sobic006G218800 Sobic005G008500--Sobic006G218800 Sobic008G120000 Sobic008G120000 Sobic005G008500--Sobic008G120000 Sobic005G008500--Sobic001G098100 Sobic005G008500--Sobic009G038600 Sobic003G182700 Sobic003G182700 Sobic005G008500--Sobic003G182700 Sobic008G111000 Sobic008G111000 Sobic005G008500--Sobic008G111000 Sobic002G079200 Sobic002G079200 Sobic005G008500--Sobic002G079200 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic005G008500--Sobic002G288800 Sobic006G265300 Sobic006G265300 Sobic009G184800--Sobic006G265300 Sobic006G128300 Sobic006G128300 Sobic009G184800--Sobic006G128300 Sobic003G434800 Sobic003G434800 Sobic009G184800--Sobic003G434800 Sobic004G157600 Sobic004G157600 Sobic009G184800--Sobic004G157600 Sobic009G184800--Sobic006G138600 Sobic003G290800 Sobic003G290800 Sobic009G184800--Sobic003G290800 Sobic002G221600 Sobic002G221600 Sobic009G184800--Sobic002G221600 Sobic001G001300 Sobic001G001300 Sobic009G184800--Sobic001G001300 Sobic001G176700 Sobic001G176700 Sobic009G184800--Sobic001G176700 Sobic008G040000--Sobic006G265300 Sobic004G352600 Sobic004G352600 Sobic008G040000--Sobic004G352600 Sobic010G232200 Sobic010G232200 Sobic008G040000--Sobic010G232200 Sobic008G040000--Sobic009G038600 Sobic001G359900 Sobic001G359900 Sobic008G040000--Sobic001G359900 Sobic004G355200 Sobic004G355200 Sobic008G040000--Sobic004G355200 Sobic005G005000 Sobic005G005000 Sobic008G040000--Sobic005G005000 Sobic003G395600 Sobic003G395600 Sobic008G040000--Sobic003G395600 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic008G040000--Sobic005G110523
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.