Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G040300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YMN9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.004G040300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G332700 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
2 Sobic.K028600 expressed protein -
3 Sobic.006G245900 FAR1 family protein, expressed -
4 Sobic.009G100000 - -
5 Sobic.002G103600 glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed K03857: PIGA, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit A
6 Sobic.006G234700 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed -
7 Sobic.003G444800 expressed protein -
8 Sobic.001G521750 - -
9 Sobic.007G018400 expressed protein -
10 Sobic.003G043000 expressed protein -
11 Sobic.001G094600 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.003G033200 F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G292800 MORN repeat domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G147400 - -
15 Sobic.002G399800 PWWP domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G040350 - -
17 Sobic.001G125500 ethylene-insensitive protein, putative, expressed K14513: ethylene-insensitive protein 2
18 Sobic.009G107300 3\'-5\' exonuclease, putative, expressed -
19 Sobic.001G308400 expressed protein -
20 Sobic.002G063900 zinc ion binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G040300 Sobic004G040300 Sobic001G332700 Sobic001G332700 Sobic004G040300--Sobic001G332700 SobicK028600 SobicK028600 Sobic004G040300--SobicK028600 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic004G040300--Sobic006G245900 Sobic009G100000 Sobic009G100000 Sobic004G040300--Sobic009G100000 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic004G040300--Sobic002G103600 Sobic006G234700 Sobic006G234700 Sobic004G040300--Sobic006G234700 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic004G040300--Sobic003G444800 Sobic001G521750 Sobic001G521750 Sobic004G040300--Sobic001G521750 Sobic007G018400 Sobic007G018400 Sobic004G040300--Sobic007G018400 Sobic005G138300 Sobic005G138300 Sobic001G332700--Sobic005G138300 Sobic001G332700--Sobic006G234700 Sobic001G332700--Sobic002G103600 Sobic001G332700--Sobic003G444800 Sobic003G243800 Sobic003G243800 Sobic001G332700--Sobic003G243800 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic001G332700--Sobic010G059500 Sobic001G376200 Sobic001G376200 Sobic001G332700--Sobic001G376200 Sobic002G260400 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Octagon: transcription factors


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