Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G140000.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R6M2
Pfam -
Panther DB PTHR37251
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G046001 - -
2 Sobic.003G156766 - -
3 Sobic.001G538800 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
4 Sobic.010G035801 - -
5 Sobic.005G023301 - -
6 Sobic.001G246200 MBTB49 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.010G116700 - -
8 Sobic.008G117900 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
9 Sobic.008G100300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G331000 OsFBX462 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G011900 - -
12 Sobic.009G162401 - -
13 Sobic.003G077600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K10140: DNA damage-binding protein 2
14 Sobic.001G078300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
15 Sobic.004G089500 - -
16 Sobic.006G239700 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G173366 - -
18 Sobic.001G246300 MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.001G271000 - -
20 Sobic.007G082200 white-brown complex homolog protein 11, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G140000 Sobic008G140000 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic008G140000--Sobic004G046001 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic008G140000--Sobic003G156766 Sobic001G538800 Sobic001G538800 Sobic008G140000--Sobic001G538800 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic008G140000--Sobic010G035801 Sobic005G023301 Sobic005G023301 Sobic008G140000--Sobic005G023301 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic008G140000--Sobic001G246200 Sobic010G116700 Sobic010G116700 Sobic008G140000--Sobic010G116700 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic008G140000--Sobic008G117900 Sobic008G100300 Sobic008G100300 Sobic008G140000--Sobic008G100300 Sobic004G046001--Sobic008G140000 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic004G046001--Sobic004G250100 Sobic008G142766 Sobic008G142766 Sobic004G046001--Sobic008G142766 Sobic001G527600 Sobic001G527600 Sobic004G046001--Sobic001G527600 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic004G046001--Sobic006G055100 Sobic003G091850 Sobic003G091850 Sobic004G046001--Sobic003G091850 Sobic008G110900 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Octagon: transcription factors


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