Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G046001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKX8
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G140000 expressed protein -
2 Sobic.004G250100 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.008G142766 - -
4 Sobic.001G527600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@radical SAM enzyme, putative, expressed K02495: hemN, oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase
5 Sobic.006G055100 - -
6 Sobic.003G091850 - -
7 Sobic.008G110900 E2F-related protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G178300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G074300 - -
10 Sobic.008G117900 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
11 Sobic.001G182300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.009G246000 expressed protein -
13 Sobic.001G490700 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.001G069300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.003G433600 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
17 Sobic.003G213800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@1,4-alpha-glucan-branching enzyme, putative, expressed K00700: GBE1, 1,4-alpha-glucan branching enzyme
18 Sobic.002G146200 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
19 Sobic.002G385200 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.005G124850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic008G140000 Sobic008G140000 Sobic004G046001--Sobic008G140000 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic004G046001--Sobic004G250100 Sobic008G142766 Sobic008G142766 Sobic004G046001--Sobic008G142766 Sobic001G527600 Sobic001G527600 Sobic004G046001--Sobic001G527600 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic004G046001--Sobic006G055100 Sobic003G091850 Sobic003G091850 Sobic004G046001--Sobic003G091850 Sobic008G110900 Sobic008G110900 Sobic004G046001--Sobic008G110900 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic004G046001--Sobic008G178300 Sobic002G074300 Sobic002G074300 Sobic004G046001--Sobic002G074300 Sobic008G140000--Sobic004G046001 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic008G140000--Sobic003G156766 Sobic001G538800 Sobic001G538800 Sobic008G140000--Sobic001G538800 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic008G140000--Sobic010G035801 Sobic005G023301 Sobic005G023301 Sobic008G140000--Sobic005G023301 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic008G140000--Sobic001G246200 Sobic010G116700 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Sobic009G064766 Sobic002G074300--Sobic009G064766 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic002G074300--Sobic008G013900
Octagon: transcription factors


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