Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G055100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKD8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G149000 astaxanthin synthase KC28, putative, expressed -
3 Sobic.008G117900 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
4 Sobic.008G052450 - -
5 Sobic.010G063433 - -
6 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
7 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G113600 - -
9 Sobic.009G026400 - -
10 Sobic.010G146200 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed -
11 Sobic.007G059300 - -
12 Sobic.008G142000 expressed protein -
13 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.002G062300 expressed protein -
15 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
16 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G108300 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14506: jasmonic acid-amino synthetase
18 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.004G200866 - -
20 Sobic.008G031350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic006G055100--Sobic010G104200 Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic006G055100--Sobic005G149000 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G117900 Sobic008G052450 Sobic008G052450 Sobic006G055100--Sobic008G052450 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G055100--Sobic010G063433 SobicK024000 SobicK024000 Sobic006G055100--SobicK024000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic006G055100--Sobic002G060500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G055100--Sobic009G113600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic006G055100--Sobic009G026400 Sobic010G104200--Sobic006G055100 Sobic010G104200--Sobic005G149000 Sobic010G104200--Sobic010G063433 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic002G007250 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic010G104200--Sobic008G009500 Sobic010G104200--SobicK024000 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic010G104200--Sobic008G031350 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic009G113600 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G149000--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G149000--Sobic001G253100 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G149000--Sobic004G076732 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic005G149000--Sobic008G079100 Sobic005G149000--Sobic008G009500 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G149000--Sobic005G110430 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic008G052450 Sobic005G149000--SobicK024000 Sobic008G117900--Sobic006G055100 Sobic004G345900 Sobic004G345900 Sobic008G117900--Sobic004G345900 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic008G117900--Sobic005G054300 Sobic008G117900--Sobic009G026400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic008G117900--Sobic009G101600 Sobic008G117900--Sobic010G104200 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic008G117900--Sobic010G146200 Sobic002G331000 Sobic002G331000 Sobic008G117900--Sobic002G331000 Sobic008G117900--Sobic005G149000 Sobic008G052450--Sobic005G149000 Sobic008G052450--Sobic006G055100 Sobic008G052450--Sobic010G104200 Sobic008G052450--Sobic005G054300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic008G052450--Sobic005G054600 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G052450--Sobic004G317600 Sobic003G121900 Sobic003G121900 Sobic008G052450--Sobic003G121900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G052450--Sobic004G121000 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G052450--Sobic001G305400 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic010G063433--Sobic001G028600 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic010G063433--Sobic001G128800 Sobic010G063433--Sobic010G104200 Sobic010G063433--Sobic006G055100 Sobic010G063433--Sobic002G007250 Sobic003G311250 Sobic003G311250 Sobic010G063433--Sobic003G311250 Sobic008G061500 Sobic008G061500 Sobic010G063433--Sobic008G061500 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic010G063433--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic010G063433--Sobic008G042250 SobicK024000--Sobic008G009500 SobicK024000--Sobic009G113600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 SobicK024000--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic009G209800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic001G253100 SobicK024000--Sobic008G079100 Sobic002G221200 Sobic002G221200 SobicK024000--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic002G060500--Sobic005G142200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic009G113600--Sobic002G062300 Sobic009G113600--Sobic007G059300 Sobic009G113600--SobicK024000 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic008G009500 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic009G113600--Sobic008G108900 Sobic009G113600--Sobic003G031750 Sobic009G113600--Sobic008G031350 Sobic009G113600--Sobic010G146200 Sobic009G026400--Sobic002G060500 Sobic009G026400--Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic007G059300 Sobic009G026400--Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic004G196500 Sobic009G026400--Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic005G054600 Sobic009G026400--Sobic005G142200 Sobic009G026400--Sobic005G054300
Octagon: transcription factors


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