Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G149000.1
Synonym
Functional annotation astaxanthin synthase KC28, putative, expressed
UniProt A0A1B6PSL1
Pfam PF03435
Panther DB PTHR12286 PTHR12286:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50450 : Saccharopine dehydrogenase
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04260.1 : astaxanthin synthase KC28, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013095
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G221425 - -
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20 Sobic.002G007250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G149000--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G149000--Sobic001G253100 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G149000--Sobic004G076732 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic005G149000--Sobic008G079100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G149000--Sobic008G009500 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G149000--Sobic005G110430 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic009G209800 Sobic008G052450 Sobic008G052450 Sobic005G149000--Sobic008G052450 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G149000--SobicK024000 Sobic005G221425--Sobic009G209800 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G221425--Sobic001G240400 Sobic005G221425--Sobic001G253100 Sobic005G221425--Sobic008G009500 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G221425--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G221425--Sobic002G056100 Sobic005G221425--SobicK024000 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G221425--Sobic005G139800 Sobic005G221425--Sobic004G076732 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G076732--Sobic004G212800 Sobic008G079100--Sobic008G042250 Sobic008G079100--Sobic009G209800 Sobic008G079100--SobicK024000 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G079100--Sobic003G031750 Sobic008G079100--Sobic001G253100 Sobic008G079100--Sobic005G110430 Sobic008G079100--Sobic008G049701 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G079100--Sobic002G062300 Sobic008G079100--Sobic008G009500 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic005G221425 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic008G052450--Sobic005G149000 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic008G052450--Sobic006G055100 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic008G052450--Sobic010G104200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic008G052450--Sobic005G054300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic008G052450--Sobic005G054600 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G052450--Sobic004G317600 Sobic003G121900 Sobic003G121900 Sobic008G052450--Sobic003G121900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G052450--Sobic004G121000 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G052450--Sobic001G305400 SobicK024000--Sobic008G009500 SobicK024000--Sobic009G113600 SobicK024000--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic009G209800 SobicK024000--Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic001G253100 SobicK024000--Sobic008G079100 Sobic002G221200 Sobic002G221200 SobicK024000--Sobic002G221200
Octagon: transcription factors


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