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Transcriptome id Sobic.008G052450.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5S8
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G149000 astaxanthin synthase KC28, putative, expressed -
2 Sobic.006G055100 - -
3 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
5 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
6 Sobic.004G317600 pathogenesis-related Bet v I family protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G121900 - -
8 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
9 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
10 Sobic.005G054000 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
11 Sobic.004G200866 - -
12 Sobic.005G142200 expressed protein -
13 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G221425 - -
15 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G047800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
17 Sobic.008G117900 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
18 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G142000 expressed protein -
20 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G052450 Sobic008G052450 Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic008G052450--Sobic005G149000 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic008G052450--Sobic006G055100 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic008G052450--Sobic010G104200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic008G052450--Sobic005G054300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic008G052450--Sobic005G054600 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G052450--Sobic004G317600 Sobic003G121900 Sobic003G121900 Sobic008G052450--Sobic003G121900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G052450--Sobic004G121000 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G052450--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G149000--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G149000--Sobic001G253100 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G149000--Sobic004G076732 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic005G149000--Sobic008G079100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G149000--Sobic008G009500 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G149000--Sobic005G110430 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic008G052450 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G149000--SobicK024000 Sobic006G055100--Sobic010G104200 Sobic006G055100--Sobic005G149000 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G052450 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G055100--Sobic010G063433 Sobic006G055100--SobicK024000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic006G055100--Sobic002G060500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G055100--Sobic009G113600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic006G055100--Sobic009G026400 Sobic010G104200--Sobic006G055100 Sobic010G104200--Sobic005G149000 Sobic010G104200--Sobic010G063433 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic008G009500 Sobic010G104200--SobicK024000 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic010G104200--Sobic008G031350 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic009G113600 Sobic005G054300--Sobic005G054600 Sobic005G054000 Sobic005G054000 Sobic005G054300--Sobic005G054000 Sobic005G054300--Sobic009G026400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G054300--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G054300--Sobic005G142200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic005G054300--Sobic002G062300 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic005G054300--Sobic005G212600 Sobic005G054300--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G054300--Sobic002G221200 Sobic005G054600--Sobic005G054300 Sobic005G054600--Sobic005G054000 Sobic005G054600--Sobic009G026400 Sobic005G054600--Sobic001G305400 Sobic005G054600--Sobic002G062300 Sobic005G054600--Sobic009G101600 Sobic005G054600--Sobic002G221200 Sobic005G054600--Sobic005G142200 Sobic005G054600--Sobic002G060500 Sobic004G317600--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G317600--Sobic001G240400 Sobic004G317600--Sobic002G221200 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic004G317600--Sobic005G117801 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic004G317600--Sobic010G144000 Sobic004G317600--Sobic001G305400 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G317600--Sobic003G436900 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic004G317600--Sobic008G091900 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic004G317600--Sobic005G061100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic003G121900--Sobic005G139800 Sobic007G132600 Sobic007G132600 Sobic003G121900--Sobic007G132600 Sobic008G142000 Sobic008G142000 Sobic003G121900--Sobic008G142000 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G121900--Sobic001G287301 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic003G121900--Sobic006G068400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G121900--Sobic001G278600 Sobic003G121900--Sobic009G209800 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic003G121900--Sobic008G025900 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic003G121900--Sobic001G128800 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic001G305400--Sobic002G221200 Sobic001G305400--Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic001G240400 Sobic001G305400--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic009G209800 Sobic001G305400--Sobic005G142200 Sobic001G305400--Sobic002G060500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic001G305400--Sobic001G261480
Octagon: transcription factors


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