Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G385200.1
Synonym Sb02g040130
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5X365
Pfam PF13041 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF462
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G26900 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38610.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048843
Brachypodium KQK15090
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G210700 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
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9 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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13 Sobic.007G179500 - -
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15 Sobic.003G051500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G347100 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
17 Sobic.005G085100 - -
18 Sobic.004G250100 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.005G011000 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
20 Sobic.002G094500 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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