Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G246000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PA72
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G159500 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G160050 - -
3 Sobic.004G046001 - -
4 Sobic.001G336450 - -
5 Sobic.005G171600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.002G079300 Protein isoflavone-7-O-methytransferase 9 (Os)(PubMedID : 27208977)@O-methyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.002G292000 - -
8 Sobic.003G118600 OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G507550 - -
10 Sobic.005G070901 - -
11 Sobic.003G047400 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.002G204700 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.006G213200 expressed protein -
14 Sobic.005G049800 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G027900 ATCHX, putative, expressed -
16 Sobic.005G031200 - -
17 Sobic.001G332933 - -
18 Sobic.002G057200 targeting protein for Xklp2, putative, expressed -
19 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G014400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G246000 Sobic009G246000 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic009G246000--Sobic001G159500 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic009G246000--Sobic007G160050 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic009G246000--Sobic004G046001 Sobic001G336450 Sobic001G336450 Sobic009G246000--Sobic001G336450 Sobic005G171600 Sobic005G171600 Sobic009G246000--Sobic005G171600 Sobic002G079300 Sobic002G079300 Sobic009G246000--Sobic002G079300 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic009G246000--Sobic002G292000 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic009G246000--Sobic003G118600 Sobic001G507550 Sobic001G507550 Sobic009G246000--Sobic001G507550 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic001G159500--Sobic003G384750 Sobic001G159500--Sobic007G160050 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G159500--Sobic003G047400 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic001G159500--Sobic001G444200 Sobic003G413550 Sobic003G413550 Sobic001G159500--Sobic003G413550 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic001G159500--Sobic004G145550 Sobic003G232500 Sobic003G232500 Sobic001G159500--Sobic003G232500 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G159500--Sobic008G057200 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic001G159500--Sobic009G174800 Sobic007G160050--Sobic003G384750 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic001G324000 Sobic007G160050--Sobic009G174800 Sobic007G160050--Sobic001G159500 Sobic007G160050--Sobic001G444200 Sobic003G215400 Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic003G215400 Sobic007G160050--Sobic008G057200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic007G160050--Sobic008G014400 Sobic002G408400 Sobic002G408400 Sobic007G160050--Sobic002G408400 Sobic008G140000 Sobic008G140000 Sobic004G046001--Sobic008G140000 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic004G046001--Sobic004G250100 Sobic008G142766 Sobic008G142766 Sobic004G046001--Sobic008G142766 Sobic001G527600 Sobic001G527600 Sobic004G046001--Sobic001G527600 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic004G046001--Sobic006G055100 Sobic003G091850 Sobic003G091850 Sobic004G046001--Sobic003G091850 Sobic008G110900 Sobic008G110900 Sobic004G046001--Sobic008G110900 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic004G046001--Sobic008G178300 Sobic002G074300 Sobic002G074300 Sobic004G046001--Sobic002G074300 Sobic008G104900 Sobic008G104900 Sobic001G336450--Sobic008G104900 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic001G336450--Sobic002G027901 Sobic001G336450--Sobic002G408400 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G336450--Sobic003G370800 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic001G336450--Sobic008G164000 Sobic005G161400 Sobic005G161400 Sobic001G336450--Sobic005G161400 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G336450--Sobic006G230000 Sobic001G336450--Sobic003G384750 Sobic001G179500 Sobic001G179500 Sobic001G336450--Sobic001G179500 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic005G171600--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic005G171600--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic005G171600--Sobic005G165950 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic005G171600--Sobic004G104250 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic005G171600--Sobic009G124100 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic005G171600--Sobic008G179400 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic005G171600--Sobic001G505033 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic005G171600--Sobic006G089350 Sobic003G116400 Sobic003G116400 Sobic005G171600--Sobic003G116400 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic002G079300--Sobic004G230000 Sobic003G344501 Sobic003G344501 Sobic002G079300--Sobic003G344501 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic002G292000--Sobic009G147450 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic002G292000--Sobic003G081200 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic002G292000--Sobic005G065050 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G292000--Sobic004G024350 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic002G292000--Sobic001G343700 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic002G292000--Sobic001G505066 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G292000--Sobic001G423666 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G292000--Sobic010G018200 Sobic002G292000--Sobic004G230000 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic003G118600--Sobic010G120900 Sobic003G118600--Sobic001G505066 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic003G118600--Sobic010G046601 Sobic003G118600--Sobic002G292000 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic003G118600--Sobic007G202360 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic003G118600--Sobic003G192500 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic003G118600--Sobic002G190600 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic003G118600--Sobic010G172633 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G118600--Sobic001G143850 Sobic001G507550--Sobic002G079300 Sobic001G507550--Sobic004G230000
Octagon: transcription factors


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