Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G213200.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5REZ5
Pfam PF12274
Panther DB PTHR23068 PTHR23068:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44792.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G213200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G189000 - -
3 Sobic.001G490700 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.007G005200 PHD-finger domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G066100 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G430400 - -
7 Sobic.004G046001 - -
8 Sobic.001G490800 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
9 Sobic.001G442800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
10 Sobic.004G053100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
12 Sobic.003G156766 - -
13 Sobic.009G246000 expressed protein -
14 Sobic.003G229400 CGMC_MAPKCMGC_2.4 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed -
15 Sobic.005G108300 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14506: jasmonic acid-amino synthetase
16 Sobic.009G064500 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed K13496: UDP-glucosyltransferase 73C
17 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
18 Sobic.001G182300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.003G176100 expressed protein -
20 Sobic.003G077600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K10140: DNA damage-binding protein 2


Gene co-expression network
sample Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic006G213200--Sobic006G141100 Sobic008G189000 Sobic008G189000 Sobic006G213200--Sobic008G189000 Sobic001G490700 Sobic001G490700 Sobic006G213200--Sobic001G490700 Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic006G213200--Sobic007G005200 Sobic004G066100 Sobic004G066100 Sobic006G213200--Sobic004G066100 Sobic002G430400 Sobic002G430400 Sobic006G213200--Sobic002G430400 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic006G213200--Sobic004G046001 Sobic001G490800 Sobic001G490800 Sobic006G213200--Sobic001G490800 Sobic001G442800 Sobic001G442800 Sobic006G213200--Sobic001G442800 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic009G051500 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Octagon: transcription factors


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