Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G005200.1
Synonym Sb07g000645
Functional annotation PHD-finger domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PES5
Pfam PF16135
Panther DB PTHR24098 PTHR24098:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004402; histone acetyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14980 : Acyl-CoA N-acyltransferase with RING/FYVE/PHD-type zinc finger protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35430.1 : PHD-finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ85506 , KQJ85507 , PNT62237
Barley HORVU2Hr1G126690.8 , HORVU2Hr1G126690.9 , HORVU2Hr1G126690.6 , HORVU2Hr1G126690.7 , HORVU2Hr1G126690.4 , HORVU2Hr1G126690.5 , HORVU2Hr1G126690.2 , HORVU2Hr1G126690.3 , HORVU2Hr1G126690.1
Wheat TraesCS2A02G563500 , TraesCS2A02G563500
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G112800 expressed protein -
3 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -
4 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
5 Sobic.001G028600 expressed protein -
6 Sobic.006G213200 expressed protein -
7 Sobic.004G230300 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
8 Sobic.009G241966 - -
9 Sobic.007G099500 hypothetical protein -
10 Sobic.003G128600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed K09527: DnaJ homolog subfamily C member 7
11 Sobic.010G063433 - -
12 Sobic.005G203400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G120000 - -
14 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
15 Sobic.001G192900 DNA excision repair protein ERCC-1, putative, expressed K10849: DNA excision repair protein ERCC-1
16 Sobic.001G490700 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.010G056100 HIRAN domain containing protein, putative, expressed K15363: FAN1, fanconi-associated nuclease 1
18 Sobic.003G350200 - -
19 Sobic.006G197500 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G124000 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic007G005200--Sobic006G141100 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic007G005200--Sobic004G112800 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic007G005200--Sobic002G139700 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic007G005200--Sobic001G408500 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic007G005200--Sobic001G028600 Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic007G005200--Sobic006G213200 Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic007G005200--Sobic004G230300 Sobic009G241966 Sobic009G241966 Sobic007G005200--Sobic009G241966 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic007G005200--Sobic007G099500 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic009G051500 Sobic009G051500 Sobic006G141100--Sobic009G051500 Sobic006G141100--Sobic006G213200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G141100--Sobic007G113101 Sobic004G112800--Sobic006G141100 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic004G112800--Sobic001G060732 Sobic004G112800--Sobic007G005200 Sobic004G112800--Sobic004G230300 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic004G112800--Sobic004G116900 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic004G112800--Sobic001G490200 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic004G112800--Sobic004G013900 Sobic004G112800--Sobic001G408500 Sobic003G156800 Sobic003G156800 Sobic004G112800--Sobic003G156800 Sobic002G139700--Sobic001G408500 Sobic002G139700--Sobic006G141100 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic002G139700--Sobic005G118900 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic002G139700--Sobic005G068300 Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic002G139700--Sobic001G095800 Sobic002G139700--Sobic009G051500 Sobic002G139700--Sobic007G005200 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic002G139700--Sobic003G124000 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic002G139700--Sobic004G268600 Sobic001G408500--Sobic002G139700 Sobic001G038800 Sobic001G038800 Sobic001G408500--Sobic001G038800 Sobic001G408500--Sobic007G005200 Sobic001G408500--Sobic004G112800 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic001G408500--Sobic004G208301 Sobic001G408500--Sobic005G068300 Sobic001G408500--Sobic003G124000 Sobic001G408500--Sobic009G051500 Sobic001G408500--Sobic001G095800 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic001G028600--Sobic002G007250 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G028600--Sobic004G212800 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic001G028600--Sobic002G108800 Sobic002G285200 Sobic002G285200 Sobic001G028600--Sobic002G285200 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic001G028600--Sobic001G345333 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic001G028600--Sobic007G156500 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G028600--Sobic010G248200 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic001G028600--Sobic002G253500 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic001G028600--Sobic008G161401 Sobic006G213200--Sobic006G141100 Sobic008G189000 Sobic008G189000 Sobic006G213200--Sobic008G189000 Sobic001G490700 Sobic001G490700 Sobic006G213200--Sobic001G490700 Sobic006G213200--Sobic007G005200 Sobic004G066100 Sobic004G066100 Sobic006G213200--Sobic004G066100 Sobic002G430400 Sobic002G430400 Sobic006G213200--Sobic002G430400 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic006G213200--Sobic004G046001 Sobic001G490800 Sobic001G490800 Sobic006G213200--Sobic001G490800 Sobic001G442800 Sobic001G442800 Sobic006G213200--Sobic001G442800 Sobic004G230300--Sobic001G060732 Sobic004G230300--Sobic004G116900 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G230300--Sobic007G223250 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic004G230300--Sobic006G123800 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G230300--Sobic002G014900 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic004G230300--Sobic001G365332 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic004G230300--Sobic003G393600 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic004G230300--Sobic002G150032 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic004G230300--Sobic010G132200 Sobic004G057700 Sobic004G057700 Sobic009G241966--Sobic004G057700 Sobic006G197500 Sobic006G197500 Sobic009G241966--Sobic006G197500 Sobic009G000600 Sobic009G000600 Sobic009G241966--Sobic009G000600 Sobic008G056350 Sobic008G056350 Sobic009G241966--Sobic008G056350 Sobic004G197000 Sobic004G197000 Sobic009G241966--Sobic004G197000 Sobic001G268700 Sobic001G268700 Sobic009G241966--Sobic001G268700 Sobic004G248700 Sobic004G248700 Sobic009G241966--Sobic004G248700 Sobic006G240900 Sobic006G240900 Sobic009G241966--Sobic006G240900 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic009G241966--Sobic002G050500 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G099500--Sobic009G059600 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic007G099500--Sobic004G164600 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic007G099500--Sobic002G090400 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G099500--Sobic007G073400 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic007G099500--Sobic003G424100 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic007G099500--Sobic004G240900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G099500--Sobic008G031350 Sobic007G099500--Sobic004G212800 Sobic002G221700 Sobic002G221700 Sobic007G099500--Sobic002G221700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.