Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G203400.2
Synonym Sb05g025870
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKN7
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF485
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G35450 : Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g43420.1 : LZ-NBS-LRR class RGA, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G062300 expressed protein -
3 Sobic.008G031350 - -
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5 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
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11 Sobic.004G164600 - -
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13 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
14 Sobic.008G042250 - -
15 Sobic.005G110430 - -
16 Sobic.004G212800 - -
17 Sobic.007G059300 - -
18 Sobic.008G091900 - -
19 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
20 Sobic.003G031750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic005G203400--Sobic005G212600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic005G203400--Sobic002G062300 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic005G203400--Sobic008G031350 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic005G203400--Sobic009G113600 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G203400--Sobic008G009500 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic005G203400--Sobic007G073400 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic005G203400--Sobic006G132200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G203400--Sobic001G253100 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic005G203400--Sobic009G196700 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G212600--SobicK024000 Sobic002G062300--Sobic009G113600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G062300--Sobic007G059300 Sobic002G062300--SobicK024000 Sobic002G062300--Sobic005G212600 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic002G062300--Sobic003G031750 Sobic002G062300--Sobic008G009500 Sobic002G062300--Sobic008G108900 Sobic002G062300--Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic001G253100 Sobic008G031350--Sobic009G113600 Sobic008G031350--Sobic008G009500 Sobic008G031350--SobicK024000 Sobic008G031350--Sobic007G073400 Sobic008G031350--Sobic002G062300 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G031350--Sobic004G164600 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic008G031350--Sobic002G007250 Sobic008G031350--Sobic005G212600 Sobic008G031350--Sobic006G132200 Sobic009G113600--Sobic002G062300 Sobic009G113600--Sobic007G059300 Sobic009G113600--SobicK024000 Sobic009G113600--Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic008G009500 Sobic009G113600--Sobic008G108900 Sobic009G113600--Sobic003G031750 Sobic009G113600--Sobic008G031350 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic009G113600--Sobic010G146200 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G009500--Sobic005G221425 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G253100--Sobic008G049701 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic009G196700--Sobic009G113600 Sobic009G196700--Sobic008G108900 Sobic009G196700--Sobic007G059300 Sobic009G196700--Sobic006G132200 Sobic009G196700--Sobic002G062300 Sobic009G196700--Sobic003G031750 Sobic009G196700--SobicK024000 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic009G196700--Sobic008G036500 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic009G196700--Sobic003G176100
Octagon: transcription factors


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