Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G112800.2,Sobic.004G112800.3
Synonym Sb04g009200
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XZ56
Pfam -
Panther DB PTHR35704 PTHR35704:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g15540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034435
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G060732 - -
3 Sobic.007G005200 PHD-finger domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G230300 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
5 Sobic.004G116900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
6 Sobic.001G490200 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed -
7 Sobic.004G013900 vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed -
8 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
9 Sobic.003G156800 - -
10 Sobic.008G120000 - -
11 Sobic.003G350200 - -
12 Sobic.001G028600 expressed protein -
13 Sobic.006G218800 - -
14 Sobic.003G089700 - -
15 Sobic.004G065700 - -
16 Sobic.010G063433 - -
17 Sobic.006G123800 - -
18 Sobic.001G365332 - -
19 Sobic.004G197700 expressed protein -
20 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic004G112800--Sobic006G141100 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic004G112800--Sobic001G060732 Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic004G112800--Sobic007G005200 Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic004G112800--Sobic004G230300 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic004G112800--Sobic004G116900 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic004G112800--Sobic001G490200 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic004G112800--Sobic004G013900 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic004G112800--Sobic001G408500 Sobic003G156800 Sobic003G156800 Sobic004G112800--Sobic003G156800 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic009G051500 Sobic009G051500 Sobic006G141100--Sobic009G051500 Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic006G141100--Sobic006G213200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G141100--Sobic007G113101 Sobic001G060732--Sobic001G490200 Sobic001G060732--Sobic004G116900 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G060732--Sobic002G288700 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G060732--Sobic001G150901 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G060732--Sobic006G123800 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic001G060732--Sobic007G223250 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G060732--Sobic002G423901 Sobic001G060732--Sobic004G013900 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic001G060732--Sobic001G059150 Sobic007G005200--Sobic006G141100 Sobic007G005200--Sobic004G112800 Sobic007G005200--Sobic002G139700 Sobic007G005200--Sobic001G408500 Sobic007G005200--Sobic001G028600 Sobic007G005200--Sobic006G213200 Sobic007G005200--Sobic004G230300 Sobic009G241966 Sobic009G241966 Sobic007G005200--Sobic009G241966 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic007G005200--Sobic007G099500 Sobic004G230300--Sobic001G060732 Sobic004G230300--Sobic004G116900 Sobic004G230300--Sobic007G223250 Sobic004G230300--Sobic006G123800 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G230300--Sobic002G014900 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic004G230300--Sobic001G365332 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic004G230300--Sobic003G393600 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic004G230300--Sobic002G150032 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic004G230300--Sobic010G132200 Sobic004G116900--Sobic006G123800 Sobic004G116900--Sobic002G288700 Sobic004G116900--Sobic007G223250 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic004G116900--Sobic001G266000 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic002G014900 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic001G490200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic004G116900--Sobic002G222000 Sobic001G490200--Sobic002G423901 Sobic001G490200--Sobic002G288700 Sobic001G490200--Sobic004G116900 Sobic001G490200--Sobic007G223250 Sobic001G490200--Sobic001G060732 Sobic001G490200--Sobic001G150901 Sobic001G490200--Sobic001G059150 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic001G490200--Sobic001G234733 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G490200--Sobic010G008433 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic004G013900--Sobic010G214950 Sobic004G013900--Sobic001G059150 Sobic004G013900--Sobic001G150901 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic004G013900--Sobic007G011100 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic004G013900--Sobic001G222150 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic004G013900--Sobic006G145650 Sobic004G013900--Sobic002G423901 Sobic004G013900--Sobic007G223250 Sobic004G013900--Sobic002G288700 Sobic001G408500--Sobic002G139700 Sobic001G038800 Sobic001G038800 Sobic001G408500--Sobic001G038800 Sobic001G408500--Sobic007G005200 Sobic001G408500--Sobic004G112800 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic001G408500--Sobic004G208301 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic001G408500--Sobic005G068300 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic001G408500--Sobic003G124000 Sobic001G408500--Sobic009G051500 Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic001G408500--Sobic001G095800 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic003G156800--Sobic001G260900 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic003G156800--Sobic007G115050 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic003G156800--Sobic002G288800 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic003G156800--Sobic002G174000 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic003G156800--Sobic004G198701 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic003G156800--Sobic001G317900
Octagon: transcription factors


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