Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G350200.4,Sobic.003G350200.3,Sobic.003G350200.1,Sobic.003G350200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0B6 , A0A1B6Q6W9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G060732 - -
2 Sobic.004G116900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
3 Sobic.005G118900 - -
4 Sobic.009G051500 expressed protein -
5 Sobic.009G027200 tetraspanin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G112800 expressed protein -
7 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -
8 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G490200 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed -
10 Sobic.006G108500 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G123800 - -
12 Sobic.006G102200 GPI transamidase component family protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G159101 - -
14 Sobic.003G053100 - -
15 Sobic.003G117850 - -
16 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
17 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
18 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
19 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I


Gene co-expression network
sample Sobic003G350200 Sobic003G350200 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic003G350200--Sobic001G060732 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic003G350200--Sobic004G116900 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic003G350200--Sobic005G118900 Sobic009G051500 Sobic009G051500 Sobic003G350200--Sobic009G051500 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G350200--Sobic009G027200 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic003G350200--Sobic004G112800 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic003G350200--Sobic002G139700 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic003G350200--Sobic006G141100 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic003G350200--Sobic001G490200 Sobic001G060732--Sobic001G490200 Sobic001G060732--Sobic004G116900 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G060732--Sobic002G288700 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G060732--Sobic001G150901 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G060732--Sobic006G123800 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic001G060732--Sobic007G223250 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G060732--Sobic002G423901 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic001G060732--Sobic004G013900 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic001G060732--Sobic001G059150 Sobic004G116900--Sobic006G123800 Sobic004G116900--Sobic002G288700 Sobic004G116900--Sobic007G223250 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic004G116900--Sobic001G266000 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic005G146900 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G116900--Sobic002G014900 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic001G490200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic004G116900--Sobic002G222000 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic001G487900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G118900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic005G118900--Sobic006G183100 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G124800 Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic005G118900--Sobic006G102200 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic005G118900--Sobic009G143750 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic002G083332 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G118900--Sobic005G104900 Sobic009G051500--Sobic005G118900 Sobic009G051500--Sobic002G139700 Sobic009G051500--Sobic006G141100 Sobic009G051500--Sobic006G102200 Sobic009G051500--Sobic003G350200 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic009G051500--Sobic004G107550 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic009G051500--Sobic003G172300 Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic009G051500--Sobic001G095800 Sobic009G051500--Sobic006G183100 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic009G027200--Sobic006G217400 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic009G027200--Sobic007G200700 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic009G027200--Sobic003G226600 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic009G027200--Sobic008G093300 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic009G027200--Sobic004G115100 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic009G027200--Sobic006G029850 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic009G027200--Sobic001G207301 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic009G027200--Sobic006G035350 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic009G027200--Sobic008G100201 Sobic004G112800--Sobic006G141100 Sobic004G112800--Sobic001G060732 Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic004G112800--Sobic007G005200 Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic004G112800--Sobic004G230300 Sobic004G112800--Sobic004G116900 Sobic004G112800--Sobic001G490200 Sobic004G112800--Sobic004G013900 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic004G112800--Sobic001G408500 Sobic003G156800 Sobic003G156800 Sobic004G112800--Sobic003G156800 Sobic002G139700--Sobic001G408500 Sobic002G139700--Sobic006G141100 Sobic002G139700--Sobic005G118900 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic002G139700--Sobic005G068300 Sobic002G139700--Sobic001G095800 Sobic002G139700--Sobic009G051500 Sobic002G139700--Sobic007G005200 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic002G139700--Sobic003G124000 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic002G139700--Sobic004G268600 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic009G051500 Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic006G141100--Sobic006G213200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G141100--Sobic007G113101 Sobic001G490200--Sobic002G423901 Sobic001G490200--Sobic002G288700 Sobic001G490200--Sobic004G116900 Sobic001G490200--Sobic007G223250 Sobic001G490200--Sobic001G060732 Sobic001G490200--Sobic001G150901 Sobic001G490200--Sobic001G059150 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic001G490200--Sobic001G234733 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G490200--Sobic010G008433
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.