Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G051500.1,Sobic.009G051500.2
Synonym Sb09g004360
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z0K3 , C5Z0K2
Pfam -
Panther DB PTHR35717 PTHR35717:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G25920 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036836
Brachypodium PNT70467 , PNT70466 , KQK07395
Barley HORVU1Hr1G022800.3 , HORVU1Hr1G022800.2 , HORVU1Hr1G022800.1
Wheat TraesCS1D02G106400 , TraesCS1D02G106400 , TraesCS1A02G097600 , TraesCS1B02G126200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G051500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
11 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
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19 Sobic.005G184900 - -
20 Sobic.003G172600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G051500 Sobic009G051500 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic009G051500--Sobic005G118900 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic009G051500--Sobic002G139700 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic009G051500--Sobic006G141100 Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic009G051500--Sobic006G102200 Sobic003G350200 Sobic003G350200 Sobic009G051500--Sobic003G350200 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic009G051500--Sobic004G107550 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic009G051500--Sobic003G172300 Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic009G051500--Sobic001G095800 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic009G051500--Sobic006G183100 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic001G487900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G118900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic006G183100 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G102200 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic005G118900--Sobic009G143750 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic002G083332 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G118900--Sobic005G104900 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic002G139700--Sobic001G408500 Sobic002G139700--Sobic006G141100 Sobic002G139700--Sobic005G118900 Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic002G139700--Sobic005G068300 Sobic002G139700--Sobic001G095800 Sobic002G139700--Sobic009G051500 Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic002G139700--Sobic007G005200 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic002G139700--Sobic003G124000 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic002G139700--Sobic004G268600 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic009G051500 Sobic006G213200 Sobic006G213200 Sobic006G141100--Sobic006G213200 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic006G141100--Sobic007G113101 Sobic006G102200--Sobic005G118900 Sobic006G102200--Sobic005G104900 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic006G102200--Sobic003G053100 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic006G102200--Sobic005G139900 Sobic006G102200--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic006G102200--Sobic003G173116 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic006G102200--Sobic003G169200 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G102200--Sobic001G230050 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic006G102200--Sobic003G159101 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic003G350200--Sobic001G060732 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic003G350200--Sobic004G116900 Sobic003G350200--Sobic005G118900 Sobic003G350200--Sobic009G051500 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G350200--Sobic009G027200 Sobic003G350200--Sobic004G112800 Sobic003G350200--Sobic002G139700 Sobic003G350200--Sobic006G141100 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic003G350200--Sobic001G490200 Sobic004G107550--Sobic001G487900 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G107550--Sobic003G064901 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic004G107550--Sobic004G103450 Sobic004G107550--Sobic009G143750 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic004G107550--Sobic002G138400 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G107550--Sobic009G102250 Sobic004G007133 Sobic004G007133 Sobic004G107550--Sobic004G007133 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G107550--Sobic001G291701 Sobic004G107550--Sobic005G118900 Sobic003G172300--Sobic003G172600 Sobic003G172300--Sobic005G139900 Sobic003G172300--Sobic003G169200 Sobic003G172300--Sobic003G173116 Sobic003G172300--Sobic003G053100 Sobic003G172300--Sobic005G104900 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic003G172300--Sobic007G183200 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172300--Sobic010G206600 Sobic003G172300--Sobic001G230050 Sobic001G095800--Sobic004G107550 Sobic001G095800--Sobic006G102200 Sobic001G095800--Sobic004G116900 Sobic001G095800--Sobic005G118900 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic001G095800--Sobic003G130200 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic001G095800--Sobic005G002050 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic001G095800--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G095800--Sobic004G210400 Sobic001G095800--Sobic004G007133 SobicK032300 SobicK032300 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G183100--Sobic007G145801
Octagon: transcription factors


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