Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G095800.1
Synonym Sb01g008590, XRCC4
Functional annotation XRCC4, putative, expressed
UniProt C5X199
Pfam PF06632
Panther DB PTHR28559
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10886; DNA-repair protein XRCC4
Gene Ontology GO:0006310; DNA recombination GO:0006302double-strand break repair GO:0005634nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23100 : homolog of human DNA ligase iv-binding protein XRCC4
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g53000.1 : XRCC4, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008079
Brachypodium PNT74168 , PNT74169
Barley HORVU5Hr1G093960.2 , HORVU5Hr1G093960.3
Wheat TraesCS5D02G390600 , TraesCS5B02G384400 , TraesCS5A02G380800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G095800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.004G087050 - -
20 Sobic.007G141650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G095800 Sobic001G095800 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic001G095800--Sobic004G107550 Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic001G095800--Sobic006G102200 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic001G095800--Sobic004G116900 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic001G095800--Sobic005G118900 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic001G095800--Sobic003G130200 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic001G095800--Sobic005G002050 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic001G095800--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G095800--Sobic004G210400 Sobic004G007133 Sobic004G007133 Sobic001G095800--Sobic004G007133 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic004G107550--Sobic001G487900 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G107550--Sobic003G064901 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic004G107550--Sobic004G103450 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic004G107550--Sobic009G143750 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic004G107550--Sobic002G138400 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G107550--Sobic009G102250 Sobic004G107550--Sobic004G007133 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G107550--Sobic001G291701 Sobic004G107550--Sobic005G118900 Sobic006G102200--Sobic005G118900 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic006G102200--Sobic005G104900 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic006G102200--Sobic003G053100 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic006G102200--Sobic005G139900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic006G102200--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic006G102200--Sobic003G173116 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic006G102200--Sobic003G169200 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G102200--Sobic001G230050 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic006G102200--Sobic003G159101 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic004G116900--Sobic006G123800 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic004G116900--Sobic002G288700 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G116900--Sobic007G223250 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic004G116900--Sobic001G266000 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic005G146900 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G116900--Sobic002G014900 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic003G173266 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic004G116900--Sobic001G490200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic004G116900--Sobic002G222000 Sobic005G118900--Sobic001G487900 Sobic005G118900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G118900--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic005G118900--Sobic006G183100 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G124800 Sobic005G118900--Sobic006G102200 Sobic005G118900--Sobic009G143750 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic002G083332 Sobic005G118900--Sobic005G104900 Sobic003G130200--Sobic002G150200 Sobic003G130200--Sobic004G210400 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G130200--Sobic002G148166 Sobic003G130200--Sobic005G002050 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G130200--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G130200--Sobic003G168425 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G130200--Sobic003G169300 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic003G130200--Sobic010G139200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G130200--Sobic004G087050 Sobic005G002050--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic002G150200 Sobic005G002050--Sobic002G148166 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic004G210400 Sobic005G002050--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic005G110493 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G002050--Sobic003G166400 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic005G002050 Sobic004G007133--Sobic009G143750 Sobic004G007133--Sobic005G118900 Sobic004G007133--Sobic001G487900 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic004G007133--Sobic001G502801 Sobic004G007133--Sobic004G107550 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic004G007133--Sobic002G358450 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic004G007133--Sobic008G040501 Sobic004G007133--Sobic006G124800 Sobic004G007133--Sobic002G138400
Octagon: transcription factors


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