Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G065700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN46
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G122000 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.001G083000 WRKY4, expressed -
3 Sobic.002G387450 - -
4 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.001G129200 receptor protein kinase TMK1 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G218400 DUF1645 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G039750 - -
8 Sobic.009G111050 - -
9 Sobic.003G238750 - -
10 Sobic.001G073550 - -
11 Sobic.006G087250 - -
12 Sobic.001G222150 - -
13 Sobic.003G354166 - -
14 Sobic.002G181066 - -
15 Sobic.003G069400 - -
16 Sobic.004G087300 flavonol-3-O-glycoside-7-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed K13496: UDP-glucosyltransferase 73C
17 Sobic.001G410400 - -
18 Sobic.007G011100 - -
19 Sobic.001G090600 Myosin head domain containing protein, expressed K10357: myosin V
20 Sobic.010G175550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G065700 Sobic004G065700 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic004G065700--Sobic006G122000 Sobic001G083000 Sobic001G083000 Sobic004G065700--Sobic001G083000 Sobic002G387450 Sobic002G387450 Sobic004G065700--Sobic002G387450 Sobic007G217200 Sobic007G217200 Sobic004G065700--Sobic007G217200 Sobic001G129200 Sobic001G129200 Sobic004G065700--Sobic001G129200 Sobic002G218400 Sobic002G218400 Sobic004G065700--Sobic002G218400 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic004G065700--Sobic001G039750 Sobic009G111050 Sobic009G111050 Sobic004G065700--Sobic009G111050 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G065700--Sobic003G238750 Sobic006G122000--Sobic002G387450 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic006G122000--Sobic001G222150 Sobic006G122000--Sobic002G218400 Sobic006G122000--Sobic007G217200 Sobic006G122000--Sobic001G083000 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic006G122000--Sobic007G011100 Sobic006G122000--Sobic003G238750 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic006G122000--Sobic003G344300 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic006G122000--Sobic010G175550 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic001G083000--Sobic005G036450 Sobic001G083000--Sobic006G122000 Sobic001G083000--Sobic001G222150 Sobic010G058600 Sobic010G058600 Sobic001G083000--Sobic010G058600 Sobic001G083000--Sobic007G217200 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G083000--Sobic001G150901 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic001G083000--Sobic003G159101 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic001G083000--Sobic004G303433 Sobic001G083000--Sobic007G011100 Sobic002G387450--Sobic002G218400 Sobic002G387450--Sobic006G122000 Sobic002G387450--Sobic001G222150 Sobic003G354166 Sobic003G354166 Sobic002G387450--Sobic003G354166 Sobic002G387450--Sobic007G011100 Sobic001G066800 Sobic001G066800 Sobic002G387450--Sobic001G066800 Sobic002G387450--Sobic009G111050 Sobic002G387450--Sobic003G344300 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic002G387450--Sobic004G334601 Sobic007G217200--Sobic001G039750 Sobic007G217200--Sobic010G175550 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic007G217200--Sobic002G159750 Sobic007G217200--Sobic003G238750 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic007G217200--Sobic001G476800 Sobic007G217200--Sobic006G122000 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic007G217200--Sobic010G196466 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic007G217200--Sobic003G069400 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic007G217200--Sobic009G210250 Sobic001G410400 Sobic001G410400 Sobic001G129200--Sobic001G410400 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic001G129200--Sobic006G087250 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic001G129200--Sobic003G137300 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic001G129200--Sobic005G068200 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G129200--Sobic006G192600 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic001G129200--Sobic008G108300 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic001G129200--Sobic001G144001 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic001G129200--Sobic008G157700 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic001G129200--Sobic009G069450 Sobic002G218400--Sobic002G387450 Sobic002G218400--Sobic006G122000 Sobic005G163932 Sobic005G163932 Sobic002G218400--Sobic005G163932 Sobic002G218400--Sobic003G354166 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic002G218400--Sobic003G119750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic002G218400--Sobic004G322650 Sobic002G218400--Sobic003G344300 Sobic001G435900 Sobic001G435900 Sobic002G218400--Sobic001G435900 Sobic004G015600 Sobic004G015600 Sobic002G218400--Sobic004G015600 Sobic001G039750--Sobic007G217200 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic001G039750--Sobic006G263250 Sobic001G039750--Sobic007G011100 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic001G039750--Sobic001G136850 Sobic001G039750--Sobic003G069400 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G039750--Sobic002G220400 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic001G039750--Sobic009G058900 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic001G039750--Sobic009G260550 Sobic001G039750--Sobic009G111050 Sobic009G111050--Sobic006G122000 Sobic009G111050--Sobic007G011100 Sobic009G111050--Sobic001G039750 Sobic009G111050--Sobic006G263250 Sobic009G111050--Sobic001G222150 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic009G111050--Sobic006G145650 Sobic009G111050--Sobic003G069400 Sobic009G111050--Sobic002G387450 Sobic009G111050--Sobic007G217200 Sobic003G238750--Sobic010G175550 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic003G238750--Sobic010G176000 Sobic003G238750--Sobic001G476800 Sobic003G238750--Sobic004G322650 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic003G238750--Sobic001G205950 Sobic003G238750--Sobic002G159750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic003G238750--Sobic008G171200 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic003G238750--Sobic004G193350 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic003G238750--Sobic001G171700
Octagon: transcription factors


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