Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G129200.2
Synonym Sb01g011320
Functional annotation receptor protein kinase TMK1 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S5F0
Pfam -
Panther DB PTHR27001 PTHR27001:SF236
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01820 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48890.1 : LRR receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G410400 - -
2 Sobic.006G087250 - -
3 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
4 Sobic.005G068200 expressed protein -
5 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
6 Sobic.008G108300 peroxisomal membrane protein, putative, expressed K13348: protein Mpv17
7 Sobic.001G144001 - -
8 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G069450 - -
10 Sobic.009G206150 - -
11 Sobic.007G226300 expressed protein -
12 Sobic.006G145650 - -
13 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
14 Sobic.006G122000 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.003G119750 - -
16 Sobic.003G393600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
18 Sobic.003G423400 OsFBX191 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G165200 - -
20 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G129200 Sobic001G129200 Sobic001G410400 Sobic001G410400 Sobic001G129200--Sobic001G410400 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic001G129200--Sobic006G087250 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic001G129200--Sobic003G137300 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic001G129200--Sobic005G068200 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G129200--Sobic006G192600 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic001G129200--Sobic008G108300 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic001G129200--Sobic001G144001 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic001G129200--Sobic008G157700 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic001G129200--Sobic009G069450 Sobic001G410400--Sobic001G129200 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic001G410400--Sobic009G206150 Sobic001G410400--Sobic006G087250 Sobic001G410400--Sobic003G137300 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic001G410400--Sobic006G145650 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic001G410400--Sobic007G226300 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G410400--Sobic004G346800 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic001G410400--Sobic007G135301 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic001G410400--Sobic001G039750 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic005G030266 Sobic005G030266 Sobic005G068200--Sobic005G030266 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic005G068200--Sobic001G249900 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic005G068200--Sobic006G147350 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic005G068200--Sobic006G130100 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G068200--Sobic006G093550 Sobic003G380800 Sobic003G380800 Sobic005G068200--Sobic003G380800 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic005G068200--Sobic010G133225 Sobic005G166900 Sobic005G166900 Sobic005G068200--Sobic005G166900 Sobic005G068200--Sobic003G393600 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic004G337600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic006G192600--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G172850 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic006G192600--Sobic003G168800 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic002G044500 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic006G192600--Sobic004G251400 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic002G165200 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic006G192600--Sobic008G160300 Sobic008G108300--Sobic002G165200 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic008G108300--Sobic001G182800 Sobic008G108300--Sobic006G192600 Sobic008G108300--Sobic003G393600 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic008G108300--Sobic010G185250 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic008G108300--Sobic010G254000 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic008G108300--Sobic003G218950 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic008G108300--Sobic003G369533 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic008G108300--Sobic001G182700 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic001G144001--Sobic009G236900 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G144001--Sobic006G131700 Sobic003G139050 Sobic003G139050 Sobic001G144001--Sobic003G139050 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic001G144001--Sobic003G113100 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic001G144001--Sobic004G282933 Sobic004G242900 Sobic004G242900 Sobic001G144001--Sobic004G242900 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G144001--Sobic009G192200 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic001G144001--Sobic003G330350 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic001G144001--Sobic001G054050 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic009G069450--Sobic005G183450 Sobic009G069450--Sobic006G020350 Sobic009G069450--Sobic006G017266 Sobic009G069450--Sobic003G128575 Sobic009G069450--Sobic008G157700 Sobic009G069450--Sobic006G124850 Sobic009G069450--Sobic006G147350 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic009G069450--Sobic005G093600 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic009G069450--Sobic003G290050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.