Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G410400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QNX8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G129200 receptor protein kinase TMK1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.009G206150 - -
3 Sobic.006G087250 - -
4 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
5 Sobic.006G145650 - -
6 Sobic.007G226300 expressed protein -
7 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
8 Sobic.007G135301 - -
9 Sobic.001G039750 - -
10 Sobic.002G348800 - -
11 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.004G081701 - -
13 Sobic.005G068200 expressed protein -
14 Sobic.001G144001 - -
15 Sobic.009G069450 - -
16 Sobic.001G045500 RD26, putative, expressed -
17 Sobic.008G108300 peroxisomal membrane protein, putative, expressed K13348: protein Mpv17
18 Sobic.001G182400 - -
19 Sobic.002G215932 - -
20 Sobic.004G013900 vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G410400 Sobic001G410400 Sobic001G129200 Sobic001G129200 Sobic001G410400--Sobic001G129200 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic001G410400--Sobic009G206150 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic001G410400--Sobic006G087250 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic001G410400--Sobic003G137300 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic001G410400--Sobic006G145650 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic001G410400--Sobic007G226300 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G410400--Sobic004G346800 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic001G410400--Sobic007G135301 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic001G410400--Sobic001G039750 Sobic001G129200--Sobic001G410400 Sobic001G129200--Sobic006G087250 Sobic001G129200--Sobic003G137300 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic001G129200--Sobic005G068200 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G129200--Sobic006G192600 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic001G129200--Sobic008G108300 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic001G129200--Sobic001G144001 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic001G129200--Sobic008G157700 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic001G129200--Sobic009G069450 Sobic001G270301 Sobic001G270301 Sobic009G206150--Sobic001G270301 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic009G206150--Sobic001G448900 Sobic009G206150--Sobic004G346800 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic009G206150--Sobic001G045500 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic009G206150--Sobic001G071250 Sobic009G206150--Sobic007G135301 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic009G206150--Sobic002G215932 Sobic004G081701 Sobic004G081701 Sobic009G206150--Sobic004G081701 Sobic009G206150--Sobic006G087250 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic006G145650--Sobic007G011100 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic006G145650--Sobic003G159300 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic006G145650--Sobic001G222150 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic006G145650--Sobic002G220400 Sobic006G145650--Sobic008G157700 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic006G145650--Sobic001G150901 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic006G145650--Sobic010G214950 Sobic006G145650--Sobic006G192600 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic006G145650--Sobic004G013900 Sobic007G226300--Sobic006G087250 Sobic007G226300--Sobic005G068200 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic007G226300--Sobic006G147350 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic007G226300--Sobic001G249900 Sobic007G226300--Sobic009G069450 Sobic007G226300--Sobic004G346800 Sobic007G226300--Sobic003G423400 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic007G226300--Sobic003G290050 Sobic007G226300--Sobic001G129200 Sobic004G346800--Sobic001G195550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic004G346800--Sobic004G346700 Sobic004G346800--Sobic001G045500 Sobic004G346800--Sobic001G071250 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic004G346800--Sobic005G008400 Sobic004G346800--Sobic009G069450 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic004G346800--Sobic002G174000 Sobic004G346800--Sobic007G135301 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic004G346800--Sobic001G365332 Sobic007G135301--Sobic001G195550 Sobic007G135301--Sobic004G346700 Sobic007G135301--Sobic004G346800 Sobic007G135301--Sobic006G087250 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic007G135301--Sobic001G417100 Sobic007G223150 Sobic007G223150 Sobic007G135301--Sobic007G223150 Sobic007G135301--Sobic001G071250 Sobic007G135301--Sobic001G045500 Sobic007G135301--Sobic009G206150 Sobic007G217200 Sobic007G217200 Sobic001G039750--Sobic007G217200 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic001G039750--Sobic006G263250 Sobic001G039750--Sobic007G011100 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic001G039750--Sobic001G136850 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G039750--Sobic003G069400 Sobic001G039750--Sobic002G220400 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic001G039750--Sobic009G058900 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic001G039750--Sobic009G260550 Sobic009G111050 Sobic009G111050 Sobic001G039750--Sobic009G111050
Octagon: transcription factors


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