Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G073550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4P1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G167600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G163666 - -
3 Sobic.006G257400 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
4 Sobic.003G368450 - -
5 Sobic.006G122000 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.001G222150 - -
7 Sobic.004G160350 - -
8 Sobic.003G069400 - -
9 Sobic.009G058900 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
10 Sobic.009G192450 - -
11 Sobic.001G181400 - -
12 Sobic.010G058600 expressed protein -
13 Sobic.001G205950 - -
14 Sobic.002G025100 expressed protein -
15 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G528900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.009G111050 - -
18 Sobic.002G181066 - -
19 Sobic.003G238750 - -
20 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic004G167600 Sobic004G167600 Sobic001G073550--Sobic004G167600 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic001G073550--Sobic010G163666 Sobic006G257400 Sobic006G257400 Sobic001G073550--Sobic006G257400 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic001G073550--Sobic003G368450 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic001G073550--Sobic006G122000 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic001G073550--Sobic001G222150 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G073550--Sobic004G160350 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G073550--Sobic003G069400 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic001G073550--Sobic009G058900 Sobic004G167600--Sobic001G073550 Sobic004G167600--Sobic006G257400 Sobic008G152400 Sobic008G152400 Sobic004G167600--Sobic008G152400 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G167600--Sobic010G088100 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic004G167600--Sobic002G033200 Sobic001G181400 Sobic001G181400 Sobic004G167600--Sobic001G181400 Sobic003G124400 Sobic003G124400 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Sobic009G058900--Sobic003G069400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic009G058900--Sobic001G323101
Octagon: transcription factors


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