Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G181400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QJL4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G181400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G058600 expressed protein -
2 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
3 Sobic.001G222150 - -
4 Sobic.010G122300 - -
5 Sobic.009G058900 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
6 Sobic.005G036450 - -
7 Sobic.001G073550 - -
8 Sobic.007G199901 - -
9 Sobic.008G039200 - -
10 Sobic.010G214950 - -
11 Sobic.003G109150 - -
12 Sobic.001G150901 - -
13 Sobic.001G136850 - -
14 Sobic.001G340100 - -
15 Sobic.001G421250 - -
16 Sobic.007G011100 - -
17 Sobic.007G054200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G083000 WRKY4, expressed -
19 Sobic.006G258100 - -
20 Sobic.002G317001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G181400 Sobic001G181400 Sobic010G058600 Sobic010G058600 Sobic001G181400--Sobic010G058600 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G181400--Sobic004G223800 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic001G181400--Sobic001G222150 Sobic010G122300 Sobic010G122300 Sobic001G181400--Sobic010G122300 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic001G181400--Sobic009G058900 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic001G181400--Sobic005G036450 Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic001G181400--Sobic001G073550 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic001G181400--Sobic007G199901 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic001G181400--Sobic008G039200 Sobic010G058600--Sobic001G222150 Sobic010G058600--Sobic001G181400 Sobic010G058600--Sobic005G036450 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic010G058600--Sobic001G205950 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic010G058600--Sobic008G156800 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic010G058600--Sobic003G286450 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic010G058600--Sobic001G400601 Sobic010G058600--Sobic009G058900 Sobic001G083000 Sobic001G083000 Sobic010G058600--Sobic001G083000 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic004G223800--Sobic003G109150 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G340100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic004G223800--Sobic001G250750 Sobic004G223800--Sobic001G400601 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic004G223800--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G009000 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic004G223800--Sobic002G074900 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic010G100600 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic004G223800--Sobic002G067900 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic001G222150--Sobic007G011100 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G222150--Sobic002G220400 Sobic001G222150--Sobic010G058600 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G222150--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G222150--Sobic004G019550 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic001G222150--Sobic006G122000 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic001G222150--Sobic003G344300 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G222150--Sobic001G150901 Sobic001G222150--Sobic003G286450 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic010G122300--Sobic001G136850 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic010G122300--Sobic004G303900 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic010G122300--Sobic009G260550 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic010G122300--Sobic009G218700 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic010G122300--Sobic003G163000 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic010G122300--Sobic003G169700 Sobic010G122300--Sobic010G058600 Sobic003G031001 Sobic003G031001 Sobic010G122300--Sobic003G031001 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic010G122300--Sobic001G422432 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic009G058900--Sobic007G054200 Sobic009G058900--Sobic008G156800 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic009G058900--Sobic007G046700 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic009G058900--Sobic006G258100 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic009G058900--Sobic003G169550 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic009G058900--Sobic004G129400 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic009G058900--Sobic004G133201 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic009G058900--Sobic003G069400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic009G058900--Sobic001G323101 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic005G036450--Sobic003G159101 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic005G036450--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G036450--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic005G036450--Sobic005G139900 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic005G036450--Sobic003G169200 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G036450--Sobic001G535850 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic005G036450--Sobic001G394532 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic005G036450--Sobic009G174150 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G036450--Sobic001G230050 Sobic004G167600 Sobic004G167600 Sobic001G073550--Sobic004G167600 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic001G073550--Sobic010G163666 Sobic006G257400 Sobic006G257400 Sobic001G073550--Sobic006G257400 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic001G073550--Sobic003G368450 Sobic001G073550--Sobic006G122000 Sobic001G073550--Sobic001G222150 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G073550--Sobic004G160350 Sobic001G073550--Sobic003G069400 Sobic001G073550--Sobic009G058900 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic007G199901--Sobic002G245700 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic007G199901--Sobic003G053100 Sobic003G351501 Sobic003G351501 Sobic007G199901--Sobic003G351501 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic007G199901--Sobic001G413300 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic007G199901--Sobic004G320900 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic007G199901--Sobic003G208200 Sobic003G172800 Sobic003G172800 Sobic007G199901--Sobic003G172800 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic007G199901--Sobic003G117850 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G199901--Sobic010G039150 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic008G039200--Sobic001G523150 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic008G039200--Sobic003G253100 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic008G039200--Sobic001G037033 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic008G039200--Sobic001G094550 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic008G039200--Sobic005G139750 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic008G039200--Sobic002G159750 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic008G039200--Sobic010G206600 Sobic008G039200--Sobic005G139900 Sobic008G039200--Sobic001G535850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.