Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G218400.1
Synonym Sb02g026000
Functional annotation DUF1645 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QCV2
Pfam -
Panther DB PTHR33095 PTHR33095:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49350.1 : DUF1645 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044618
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G387450 - -
2 Sobic.006G122000 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.005G163932 - -
4 Sobic.003G354166 - -
5 Sobic.003G119750 - -
6 Sobic.004G322650 - -
7 Sobic.003G344300 - -
8 Sobic.001G435900 expressed protein -
9 Sobic.004G015600 - -
10 Sobic.001G278650 - -
11 Sobic.007G004750 - -
12 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
13 Sobic.003G238750 - -
14 Sobic.001G182900 - -
15 Sobic.001G128000 expressed protein -
16 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
17 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
18 Sobic.001G222150 - -
19 Sobic.004G268600 nodulin, putative, expressed -
20 Sobic.010G132200 inhibitor I family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G218400 Sobic002G218400 Sobic002G387450 Sobic002G387450 Sobic002G218400--Sobic002G387450 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic002G218400--Sobic006G122000 Sobic005G163932 Sobic005G163932 Sobic002G218400--Sobic005G163932 Sobic003G354166 Sobic003G354166 Sobic002G218400--Sobic003G354166 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic002G218400--Sobic003G119750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic002G218400--Sobic004G322650 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic002G218400--Sobic003G344300 Sobic001G435900 Sobic001G435900 Sobic002G218400--Sobic001G435900 Sobic004G015600 Sobic004G015600 Sobic002G218400--Sobic004G015600 Sobic002G387450--Sobic002G218400 Sobic002G387450--Sobic006G122000 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic002G387450--Sobic001G222150 Sobic002G387450--Sobic003G354166 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic002G387450--Sobic007G011100 Sobic001G066800 Sobic001G066800 Sobic002G387450--Sobic001G066800 Sobic009G111050 Sobic009G111050 Sobic002G387450--Sobic009G111050 Sobic002G387450--Sobic003G344300 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic002G387450--Sobic004G334601 Sobic006G122000--Sobic002G387450 Sobic006G122000--Sobic001G222150 Sobic006G122000--Sobic002G218400 Sobic007G217200 Sobic007G217200 Sobic006G122000--Sobic007G217200 Sobic001G083000 Sobic001G083000 Sobic006G122000--Sobic001G083000 Sobic006G122000--Sobic007G011100 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic006G122000--Sobic003G238750 Sobic006G122000--Sobic003G344300 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic006G122000--Sobic010G175550 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic005G163932--Sobic003G337200 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic005G163932--Sobic001G128000 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic005G163932--Sobic004G268600 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic005G163932--Sobic002G180732 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic005G163932--Sobic004G234766 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic005G163932--Sobic001G054050 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic005G163932--Sobic003G160433 Sobic005G163932--Sobic003G119750 Sobic005G163932--Sobic002G218400 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G354166--Sobic001G293900 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic003G354166--Sobic007G004750 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic003G354166--Sobic003G255850 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G354166--Sobic003G128575 Sobic003G354166--Sobic003G119750 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G354166--Sobic006G017266 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic003G354166--Sobic005G183450 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic003G354166--Sobic010G132200 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic003G354166--Sobic006G124850 Sobic003G119750--Sobic001G293900 Sobic003G119750--Sobic003G344300 Sobic003G119750--Sobic007G004750 Sobic003G119750--Sobic010G132200 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G119750--Sobic003G168800 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G119750--Sobic003G423400 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic003G119750--Sobic006G192600 Sobic003G119750--Sobic001G128000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G119750--Sobic003G169400 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G322650--Sobic008G171200 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic004G322650--Sobic001G171700 Sobic004G322650--Sobic003G238750 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic004G322650--Sobic001G278650 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic004G157050 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G322650--Sobic001G476800 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic004G322650--Sobic001G182900 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic004G322650--Sobic005G216900 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic004G322650--Sobic002G157050 Sobic003G344300--Sobic003G168800 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic002G165200 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G344300--Sobic004G019550 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic003G344300--Sobic010G035600 Sobic003G344300--Sobic003G119750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G344300--Sobic001G154000 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic003G344300--Sobic010G185250 Sobic003G344300--Sobic001G293900 Sobic003G344300--Sobic006G192600 Sobic001G435900--Sobic003G119750 Sobic001G435900--Sobic001G293900 Sobic001G435900--Sobic003G168800 Sobic001G435900--Sobic010G132200 Sobic001G435900--Sobic004G268600 Sobic001G435900--Sobic003G423400 Sobic001G435900--Sobic003G344300 Sobic001G435900--Sobic002G218400 Sobic001G435900--Sobic001G128000 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic004G015600--Sobic001G394532 Sobic005G184900 Sobic005G184900 Sobic004G015600--Sobic005G184900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic004G015600--Sobic004G303433 Sobic004G015600--Sobic001G182900 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G015600--Sobic003G286450 Sobic004G015600--Sobic001G278650 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G015600--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G015600--Sobic001G535850 Sobic004G015600--Sobic001G171700
Octagon: transcription factors


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