Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G230300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YR61
Pfam -
Panther DB PTHR23273 PTHR23273:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology K07466; RFA1, RPA1, replication factor A1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52950 : Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02230.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G060732 - -
2 Sobic.004G116900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
3 Sobic.007G223250 - -
4 Sobic.006G123800 - -
5 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G365332 - -
7 Sobic.003G393600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G150032 - -
9 Sobic.010G132200 inhibitor I family protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G290050 - -
11 Sobic.004G198701 - -
12 Sobic.001G266000 OsClp10 - Putative Clp protease homologue, expressed -
13 Sobic.002G149966 - -
14 Sobic.003G168350 - -
15 Sobic.004G346700 expressed protein -
16 Sobic.001G071250 - -
17 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
18 Sobic.006G005550 - -
19 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
20 Sobic.007G223150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G230300 Sobic004G230300 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic004G230300--Sobic001G060732 Sobic004G116900 Sobic004G116900 Sobic004G230300--Sobic004G116900 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G230300--Sobic007G223250 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic004G230300--Sobic006G123800 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G230300--Sobic002G014900 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic004G230300--Sobic001G365332 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic004G230300--Sobic003G393600 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic004G230300--Sobic002G150032 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic004G230300--Sobic010G132200 Sobic001G490200 Sobic001G490200 Sobic001G060732--Sobic001G490200 Sobic001G060732--Sobic004G116900 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G060732--Sobic002G288700 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G060732--Sobic001G150901 Sobic001G060732--Sobic006G123800 Sobic001G060732--Sobic007G223250 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G060732--Sobic002G423901 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic001G060732--Sobic004G013900 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic001G060732--Sobic001G059150 Sobic004G116900--Sobic006G123800 Sobic004G116900--Sobic002G288700 Sobic004G116900--Sobic007G223250 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic004G116900--Sobic001G266000 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic005G146900 Sobic004G116900--Sobic002G014900 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic003G173266 Sobic004G116900--Sobic001G490200 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic004G116900--Sobic002G222000 Sobic007G223250--Sobic002G288700 Sobic007G223250--Sobic002G014900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic007G223250--Sobic004G087000 Sobic007G223250--Sobic006G123800 Sobic007G223250--Sobic001G266000 Sobic007G223250--Sobic002G150032 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G223250--Sobic003G172900 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic004G251400 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic007G223250--Sobic007G109200 Sobic006G123800--Sobic001G266000 Sobic006G123800--Sobic003G173266 Sobic006G123800--Sobic002G288700 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic006G123800--Sobic003G172850 Sobic006G123800--Sobic003G172900 Sobic006G123800--Sobic002G014900 Sobic006G123800--Sobic002G150032 Sobic006G123800--Sobic004G251400 Sobic006G123800--Sobic007G223250 Sobic002G014900--Sobic002G150032 Sobic002G014900--Sobic001G266000 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic003G172900 Sobic002G014900--Sobic003G172850 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic002G044500 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic002G014900--Sobic006G124850 Sobic002G014900--Sobic004G251400 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic002G014900--Sobic003G290050 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic001G365332--Sobic003G168350 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G078450 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic001G365332--Sobic006G005550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic001G365332--Sobic004G346700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic001G365332--Sobic005G183450 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic001G365332--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic001G365332--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic003G128575 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic001G365332--Sobic005G008400 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic003G393600--Sobic010G254000 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G393600--Sobic008G108300 Sobic003G393600--Sobic003G290050 Sobic003G393600--Sobic002G044500 Sobic003G393600--Sobic002G149966 Sobic003G393600--Sobic001G266000 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G393600--Sobic003G168500 Sobic003G393600--Sobic002G222000 Sobic003G393600--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G014900 Sobic002G150032--Sobic001G266000 Sobic002G150032--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G044500 Sobic002G150032--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic006G124850 Sobic002G150032--Sobic004G251400 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic010G132200--Sobic001G293900 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic010G132200--Sobic003G169400 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic010G132200--Sobic010G107601 Sobic010G132200--Sobic003G168500 Sobic010G132200--Sobic003G172850 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic010G132200--Sobic003G423400 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G132200--Sobic003G168800 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic010G132200--Sobic003G171900 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic010G132200--Sobic003G172400
Octagon: transcription factors


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