Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G146200.1
Synonym emb1027
Functional annotation arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QBD9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26300 : Arginyl-tRNA synthetase, class Ic
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07030.2 : arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G116900 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.004G046001 - -
3 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
4 Sobic.006G034650 - -
5 Sobic.008G083700 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G376800 nitroreductase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G110487 - -
8 Sobic.001G150066 - -
9 Sobic.001G092250 - -
10 Sobic.009G239101 - -
11 Sobic.007G101000 - -
12 Sobic.003G301400 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03509: DNA polymerase eta
13 Sobic.002G181400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13175: THO complex subunit 6
14 Sobic.007G145901 - K02705: photosystem II CP43 chlorophyll apoprotein
15 Sobic.009G085001 - -
16 Sobic.010G061300 receptor protein kinase, putative, expressed -
17 Sobic.004G231850 - -
18 Sobic.001G216900 - -
19 Sobic.005G039350 - -
20 Sobic.001G530000 expressed protein K19323: ataxin-10


Gene co-expression network
sample Sobic002G146200 Sobic002G146200 Sobic010G116900 Sobic010G116900 Sobic002G146200--Sobic010G116900 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic002G146200--Sobic004G046001 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G146200--Sobic005G043100 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic002G146200--Sobic006G034650 Sobic008G083700 Sobic008G083700 Sobic002G146200--Sobic008G083700 Sobic003G376800 Sobic003G376800 Sobic002G146200--Sobic003G376800 Sobic005G110487 Sobic005G110487 Sobic002G146200--Sobic005G110487 Sobic001G150066 Sobic001G150066 Sobic002G146200--Sobic001G150066 Sobic001G092250 Sobic001G092250 Sobic002G146200--Sobic001G092250 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic010G116900--Sobic007G101000 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic010G116900--Sobic005G181600 Sobic008G041600 Sobic008G041600 Sobic010G116900--Sobic008G041600 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic010G116900--Sobic001G216900 Sobic010G116900--Sobic002G146200 Sobic010G116900--Sobic005G110487 Sobic010G116900--Sobic006G034650 Sobic003G033400 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Octagon: transcription factors


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