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Transcriptome id Sobic.001G092250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5H6
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G030500 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
2 Sobic.007G113101 - -
3 Sobic.003G124000 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G102200 GPI transamidase component family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G246000 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14780: DHX37, ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1
6 Sobic.007G085400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G095100 ORG4, putative, expressed -
8 Sobic.001G060732 - -
9 Sobic.010G186900 - -
10 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
11 Sobic.001G490200 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.003G172800 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
13 Sobic.008G093300 - -
14 Sobic.005G118900 - -
15 Sobic.003G351501 - -
16 Sobic.004G128100 ATP-binding cassette sub-family E member 1, putative, expressed K06174: ABCE1, ATP-binding cassette, sub-family E, member 1
17 Sobic.004G116900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
18 Sobic.002G139700 tubulin binding cofactor C, putative, expressed -
19 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G049200 violaxanthin de-epoxidase, putative, expressed K09839: VDE, violaxanthin de-epoxidase


Gene co-expression network
sample Sobic001G092250 Sobic001G092250 Sobic003G030500 Sobic003G030500 Sobic001G092250--Sobic003G030500 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic001G092250--Sobic007G113101 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic001G092250--Sobic003G124000 Sobic006G102200 Sobic006G102200 Sobic001G092250--Sobic006G102200 Sobic004G246000 Sobic004G246000 Sobic001G092250--Sobic004G246000 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic001G092250--Sobic007G085400 Sobic006G095100 Sobic006G095100 Sobic001G092250--Sobic006G095100 Sobic001G060732 Sobic001G060732 Sobic001G092250--Sobic001G060732 Sobic010G186900 Sobic010G186900 Sobic001G092250--Sobic010G186900 Sobic007G102600 Sobic007G102600 Sobic003G030500--Sobic007G102600 Sobic003G030500--Sobic006G095100 Sobic003G030500--Sobic003G124000 Sobic003G030500--Sobic001G092250 Sobic005G086250 Sobic005G086250 Sobic003G030500--Sobic005G086250 Sobic003G030500--Sobic004G246000 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic003G030500--Sobic005G194400 Sobic007G134300 Sobic007G134300 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Octagon: transcription factors


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